Transmembranski protein 241 (aka C18orf45, hVVT) je sveprisutni proteinski transporter šećera koji je kod ljudi kodiran genom TMEM241.
Gen U ljudi gen TMEM241 sadrži 142.188 bp, na 1poziciji 8q11.2, sa 24 egzona.
Nalazi u blizini gena CABLES1, RIOK3 i NPC1, na hromosomu 18.
iRNK thumb|Izoforma 1 5' UTR (netraslacijska regija) TMEM241-ove ukosnice |153x153px Primarna iRNK za ljudski TMEM241, izoformu 1, sadrži petlju UTR ukosničku petlju koja je kod primata konzervirana. Primarna iRNK za ljudsu izoformu 1 TMEM241 sadrži mjesta vezanja u svom 3 'UTR za miRNK 520f-5p, 378a-5p i 6866-5p.
Protein Dužina polipeptidnog lanca je 296 aminokiselina, sa molekulskom težinom od 32.647.
Aminokiselinska sekvenca
1020304050 MCVRRSLVGLTFCTCYLASYLTNKYVLSVLKFTYPTLFQGWQTLIGGLLL HVSWKLGWVEINSSSRSHVLVWLPASVLFVGIIYAGSRALSRLAIPVFLT LHNVAEVIICGYQKCFQKEKTSPAKICSALLLLAAAGCLPFNDSQFNPDG YFWAIIHLLCVGAYKILQKSQKPSALSDIDQQYLNYIFSVVLLAFASHPT GDLFSVLDFPFLYFYRFHGSCCASGFLGFFLMFSTVKLKNLLAPGQCAAW IFFAKIITAGLSILLFDAILTSATTGCLLLGALGEALLVFSERKSS Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
Opća svojstva Postoji više od 10 varijanti transkripta predviđenih za ljudski gen TMEM241 pronađen na BLAST-u. Izoform 1 je mase oko 31 kDa. Protein ima izoelektričnu tačku 8,7, a posebno je bogat aminokiselinom fenilalaninom, koja sadrži dvostruko veći udio od ove aminokiseline.
Konzervirani domeni thumb|Detalji strukture izoforme 1 TMEM24 thumb|Dijagram alfa-heliksnog točka izoforme 1 TMEM241, sa hidrofobnim i hidrofilnim interakcijama regije s lipidnom membranom. TMEM241 sastavljen je od devet transmembranskih domena, tvoreći hidrofobnu integralnu komponentu membrane sastavljen prvenstveno od alfa-heliksnih TMEM241 sadrži VRG4 (glikozilacija otporna na vandate)) domen sa homologijom domena transportera šećera VRG4 iz Saccharomyces cerevisiae (kvasac).
Posttranslacijska modifikacija thumb|Mjesro postranslacijske modifikacije izoforme 1 TMEM241 Predviđa se da će TMEM241 biti podvrgnut raznim fosforilacijama, glikolizaciji, palmitoilaciji. Naprimjer, izoforma 1TMEM241 ima mjesta fosforilacije na S6, 64, 170, 177, 291, 295 i 296, mjestima glikacije na K125, 169 i 172; mjesta palmitoilacije na C13, 15, 221.
Interaktivni proteini Postoje neki dokazi da ovaj protein može stupiti u interakciju s keratinskim filamentom, zasnovanom na dva hibridna mjesta s keratinskim proteinom KRT40.
Ekspresija
TMEM241 će se vjerovatno eksprimiratii u svim tkivima na različitim nivoima od bazne do umjerene ekspresije. Neke studije su pronašle promjene u ekspresiji TMEM241. Naprimjer, u slučajevima akutne megakarioblastne leukemije, utvrđeno je da je TMEM241 jedan od najnadguliranijih gena. U drugom slučaju je utvrđeno da je TMEM241 povišen u regulaciji tokom nerazvijenog proteinskog odgovora nakon prekomerne ekspresije Ero1α (endoplasmatskog retikulumskog oksidoreduklin 1α).
Homologija TMEM241 je konzerviran širom eukariota.
Ortolozi thumb|Stopa divergencije TMEM241 TMEM241 je konzerviran kod svih životinja, a homolozi se nalaze u svim eukariotima. TMEM241 ima 19% globalnog identiteta i 60% identiteta prema BDP-transporteru manoze sa S. cerevisiae, koja sadrži VRG4 domen. Vjerovatno je da je TMEM241 transporter bruto-manoze zbog ove sličnosti. Grafikon s desne strane prikazuje relativni nivo konzerviranosti TMEM241 u mnogim vrstama organizama, koristeći princip molekulskog sata. Naučno imeUobičajeno imeDivergencija od H. sapiens (milioni godina)Dućina proteina (aminookiselina) Identitet (%) sa H. sapiens Pristupni brojHomo sapiensČovjek0296100NP_116322Mus musculusMiš90,129784NP_001276595Calidris pugnaxRuf (ptica)320,529680XP_003219697Python bivittatusPiton320,529674XP_014793906Xenopus laevisKandžata žaba354,429369NP_001091222Salmo salarLosos436829663XP_014036453Octopus bimaculoidesOktopus90329135XP_014776992Halyomorpha halysSmrdibuba90325732XP_014284006Saccharomyces cerevisiaeKvasac1335,521625AJS02580Coccomyxa subellipsoidea Zelene alge1570,529628XP_005651133
Paralozi TMEM241 ma dva paraloga kod ljudi koji imaju homologe u svim eukariotima, UGTREL8 i UGTREL7. TMEM241, UGTREL8 i UGTREL7 su porodica proteina za transport šećera s bliskim identitetom s BDP-transporterom manoze identificiranim u S. cerevisiae.
% Identity TMEM241 (H.sapiens)UGTREL7 (H.sapiens)UGTREL8 (H.sapiens)Transporter manoze GDP (S. cerevisiae)TMEM241 (H. sapiens)100%19,9%23,9%19,0%19.9%100%52,2%18,8%UGTREL8 (H. sapiens)23,9%52,2%100%19,9%Transporter manoze GDP (S. cerivisiae)19,0%18,8%19,9%100%
Reference
Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Geni na hromosomu 18 Kategorija:Proteomika