ATP-ovisna RNK-helikaza DDX24 je enzim koji je kod ljudi kodiran genom DDX24.
DEAD-boksni proteini, poput DDX24, pretpostavljene su RNK-helikaze, koje posreduju odmotavanju dvolančane RNK ovisno o nukleozid-trifosfatu. U svojoj osnovnoj regiji, proteini DEAD-boksa sadrže devet konzerviranih motiva, od kojih jedan, asp–glu–ala–asp (DEAD), daje ime porodici.
Zhao et al. (2000) utvrdili su da se gen DDX24 proteže na 30 kb i da sadrži najmanje devet egzona. Radijacijskom hibridnom analizom, mapirali su gen DDX24 na poziciji 14q32.Zhao, Y., Yu, L., Fu, Q., Chen, W., Jiang, J., Gao, J., Zhao, S. Cloning and characterization of human DDX24 and mouse Ddx24, two novel putative DEAD-box proteins, and mapping DDX24 to human chromosome 14q32. Genomics 67: 351-355, 2000. PubMed: 10936056
Uključeni su u brojne molekulske procese ćelija koji uključuju izmjenu sekundarne strukture RNK, kao što je translacija inicijacija, jedarna i mitohondrijska prerada RNK i sklapanje ribosoma i splajsosoma. Na osnovu njihovih obrazaca raspodjele, vjeruje se da su neki članovi ove porodice uključeni u embriogenezu, spermatogenezu, rast i diobu ćelija. Ovaj gen kodira protein DEAD-boksa, koji pokazuje malu sličnost s bilo kojim njegovim drugim poznatim ljudskim proteinima, ali pokazuje veliku sličnost s mišjim Ddx24 na nivou aminokiselina.
Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 859 aminokiselina, a molekulska težina 96.332 Da..
1020304050 MKLKDTKSRPKQSSCGKFQTKGIKVVGKWKEVKIDPNMFADGQMDDLVCF EELTDYQLVSPAKNPSSLFSKEAPKRKAQAVSEEEEEEEGKSSSPKKKIK LKKSKNVATEGTSTQKEFEVKDPELEAQGDDMVCDDPEAGEMTSENLVQT APKKKKNKGKKGLEPSQSTAAKVPKKAKTWIPEVHDQKADVSAWKDLFVP RPVLRALSFLGFSAPTPIQALTLAPAIRDKLDILGAAETGSGKTLAFAIP MIHAVLQWQKRNAAPPPSNTEAPPGETRTEAGAETRSPGKAEAESDALPD DTVIESEALPSDIAAEARAKTGGTVSDQALLFGDDDAGEGPSSLIREKPV PKQNENEEENLDKEQTGNLKQELDDKSATCKAYPKRPLLGLVLTPTRELA VQVKQHIDAVARFTGIKTAILVGGMSTQKQQRMLNRRPEIVVATPGRLWE LIKEKHYHLRNLRQLRCLVVDEADRMVEKGHFAELSQLLEMLNDSQYNPK RQTLVFSATLTLVHQAPARILHKKHTKKMDKTAKLDLLMQKIGMRGKPKV IDLTRNEATVETLTETKIHCETDEKDFYLYYFLMQYPGRSLVFANSISCI KRLSGLLKVLDIMPLTLHACMHQKQRLRNLEQFARLEDCVLLATDVAARG LDIPKVQHVIHYQVPRTSEIYVHRSGRTARATNEGLSLMLIGPEDVINFK KIYKTLKKDEDIPLFPVQTKYMDVVKERIRLARQIEKSEYRNFQACLHNS WIEQAAAALEIELEEDMYKGGKADQQEERRRQKQMKVLKKELRHLLSQPL FTESQKTKYPTQSGKPPLLVSAPSKSESALSCLSKQKKKKTKKPKEPQPE QPQPSTSAN Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
Kloniranje i ekspresija Pregledom EST baze podataka za sekvence s uzorkom DEAD-boksne helikaze, nakon čega slijedi PCR na bibliotekama cDNK sjemenika i leukemije, gorepomenuti Zhao et al. (2000) dobili su cDNK koje kodiraju DDX24 čovjeka i miša. Izvedeni ljudskii protein s 859 aminokiselina je 79% identičan mišjem proteinu, ali samo 40% identičan ostalim ljudskim članovima porodice u jezgri regije. DDX24 sadrži sve sačuvane DDX motive, uključujući one za aktivnosti helikaza, ATPaza i RNK-interakcija, ali ima razmak od 150 aminokiselina između motiva I i Ia, umjesto uobičajenog od 24 do 42 aminokiselina. Northern blot analiza otkrila je sveprisutnu ekspresiju transkripta od 3,0 kb, s najvišim nivoima u srcu i mozgu i jedva uočljivim nivoima u timusu i tankom crijevu.
Reference
Dopunska literatura
Kategorija:Geni na hromosomu 14 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika