Bradavicoliki protein-B (NIPBL), znan i kao SCC2 ili delangin jest protein koji je kod ljudi kodiran genom NIPBL sa hromosoma 5. NIPBL je potreban za povezivanje kohezina s DNK i glavna je podjedinica kompleksa za punjenje kohezina. Heterozigotne mutacije u NIPBL čine oko 60% slučajeva sindroma Cornelije de Lange.
Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 2.804 aminokiseline, а molekulska težina 316.051 Da..
1020304050 MNGDMPHVPITTLAGIASLTDLLNQLPLPSPLPATTTKSLLFNARIAEEV NCLLACRDDNLVSQLVHSLNQVSTDHIELKDNLGSDDPEGDIPVLLQAVL ARSPNVFREKSMQNRYVQSGMMMSQYKLSQNSMHSSPASSNYQQTTISHS PSSRFVPPQTSSGNRFMPQQNSPVPSPYAPQSPAGYMPYSHPSSYTTHPQ MQQASVSSPIVAGGLRNIHDNKVSGPLSGNSANHHADNPRHGSSEDYLHM VHRLSSDDGDSSTMRNAASFPLRSPQPVCSPAGSEGTPKGSRPPLILQSQ SLPCSSPRDVPPDILLDSPERKQKKQKKMKLGKDEKEQSEKAAMYDIISS PSKDSTKLTLRLSRVRSSDMDQQEDMISGVENSNVSENDIPFNVQYPGQT SKTPITPQDINRPLNAAQCLSQQEQTAFLPANQVPVLQQNTSVAAKQPQT SVVQNQQQISQQGPIYDEVELDALAEIERIERESAIERERFSKEVQDKDK PLKKRKQDSYPQEAGGATGGNRPASQETGSTGNGSRPALMVSIDLHQAGR VDSQASITQDSDSIKKPEEIKQCNDAPVSVLQEDIVGSLKSTPENHPETP KKKSDPELSKSEMKQSESRLAESKPNENRLVETKSSENKLETKVETQTEE LKQNESRTTECKQNESTIVEPKQNENRLSDTKPNDNKQNNGRSETTKSRP ETPKQKGESRPETPKQKSDGHPETPKQKGDGRPETPKQKGESRPETPKQK NEGRPETPKHRHDNRRDSGKPSTEKKPEVSKHKQDTKSDSPRLKSERAEA LKQRPDGRSVSESLRRDHDNKQKSDDRGESERHRGDQSRVRRPETLRSSS RNEHGIKSDSSKTDKLERKHRHESGDSRERPSSGEQKSRPDSPRVKQGDS NKSRSDKLGFKSPTSKDDKRTEGNKSKVDTNKAHPDNKAEFPSYLLGGRS GALKNFVIPKIKRDKDGNVTQETKKMEMKGEPKDKVEKIGLVEDLNKGAK PVVVLQKLSLDDVQKLIKDREDKSRSSLKPIKNKPSKSNKGSIDQSVLKE LPPELLAEIESTMPLCERVKMNKRKRSTVNEKPKYAEISSDEDNDSDEAF ESSRKRHKKDDDKAWEYEERDRRSSGDHRRSGHSHEGRRSSGGGRYRNRS PSDSDMEDYSPPPSLSEVARKMKKKEKQKKRKAYEPKLTPEEMMDSSTFK RFTASIENILDNLEDMDFTAFGDDDEIPQELLLGKHQLNELGSESAKIKA MGIMDKLSTDKTVKVLNILEKNIQDGSKLSTLLNHNNDTEEEERLWRDLI MERVTKSADACLTTINIMTSPNMPKAVYIEDVIERVIQYTKFHLQNTLYP QYDPVYRLDPHGGGLLSSKAKRAKCSTHKQRVIVMLYNKVCDIVSSLSEL LEIQLLTDTTILQVSSMGITPFFVENVSELQLCAIKLVTAVFSRYEKHRQ LILEEIFTSLARLPTSKRSLRNFRLNSSDMDGEPMYIQMVTALVLQLIQC VVHLPSSEKDSNAEEDSNKKIDQDVVITNSYETAMRTAQNFLSIFLKKCG SKQGEEDYRPLFENFVQDLLSTVNKPEWPAAELLLSLLGRLLVHQFSNKS TEMALRVASLDYLGTVAARLRKDAVTSKMDQGSIERILKQVSGGEDEIQQ LQKALLDYLDENTETDPSLVFSRKFYIAQWFRDTTLETEKAMKSQKDEES SEGTHHAKEIETTGQIMHRAENRKKFLRSIIKTTPSQFSTLKMNSDTVDY DDACLIVRYLASMRPFAQSFDIYLTQILRVLGENAIAVRTKAMKCLSEVV AVDPSILARLDMQRGVHGRLMDNSTSVREAAVELLGRFVLCRPQLAEQYY DMLIERILDTGISVRKRVIKILRDICIEQPTFPKITEMCVKMIRRVNDEE GIKKLVNETFQKLWFTPTPHNDKEAMTRKILNITDVVAACRDTGYDWFEQ LLQNLLKSEEDSSYKPVKKACTQLVDNLVEHILKYEESLADSDNKGVNSG RLVACITTLFLFSKIRPQLMVKHAMTMQPYLTTKCSTQNDFMVICNVAKI LELVVPLMEHPSETFLATIEEDLMKLIIKYGMTVVQHCVSCLGAVVNKVT QNFKFVWACFNRYYGAISKLKSQHQEDPNNTSLLTNKPALLRSLFTVGAL CRHFDFDLEDFKGNSKVNIKDKVLELLMYFTKHSDEEVQTKAIIGLGFAF IQHPSLMFEQEVKNLYNNILSDKNSSVNLKIQVLKNLQTYLQEEDTRMQQ ADRDWKKVAKQEDLKEMGDVSSGMSSSIMQLYLKQVLEAFFHTQSSVRHF ALNVIALTLNQGLIHPVQCVPYLIAMGTDPEPAMRNKADQQLVEIDKKYA GFIHMKAVAGMKMSYQVQQAINTCLKDPVRGFRQDESSSALCSHLYSMIR GNRQHRRAFLISLLNLFDDTAKTDVTMLLYIADNLACFPYQTQEEPLFIM HHIDITLSVSGSNLLQSFKESMVKDKRKERKSSPSKENESSDSEEEVSRP RKSRKRVDSDSDSDSEDDINSVMKCLPENSAPLIEFANVSQGILLLLMLK QHLKNLCGFSDSKIQKYSPSESAKVYDKAINRKTGVHFHPKQTLDFLRSD MANSKITEEVKRSIVKQYLDFKLLMEHLDPDEEEEEGEVSASTNARNKAI TSLLGGGSPKNNTAAETEDDESDGEDRGGGTSGSLRRSKRNSDSTELAAQ MNESVDVMDVIAICCPKYKDRPQIARVVQKTSSGFSVQWMAGSYSGSWTE AKRRDGRKLVPWVDTIKESDIIYKKIALTSANKLTNKVVQTLRSLYAAKD GTSS
Struktura i interakcije thumb|left|Struktura SCC4 (zeleno) u kompleksu sa N-terminalnim domenom SCC2 (plavo) pupajučeg kvasca (Hinshaw et al., 2015) NIPBL je veliki kukasti protein koji sadrži HEAT-ponavljanje. Formira kompleks sa MAU2 (SCC4 u pupajućem kvascu), poznat kao kompleks kohezinskog utovara. Kako ovo ime sugerira, NiPBL i MAU2 potrebni su za početno udruženje kohezina sa DNK.
Smatra se da kohezin posreduje interakcije poboljšavač-promotor i generira topološki udružujuće domene (TADS) kao i posredovanje kohezije i reguliranje arhitekture DNK. Kompleks kohezina potreban je za popravak DNK homolognom rekombinacijom. S obzirom da je NIPBL potreban za udruživanje kohezina s DNK, smatra se da je i NiPBL potreban za sve ove procese. Dosljedno, inaktivacija NiPBL-a rezultira u topološkom udruživanju gubitaka i kohezije.
NIPBL se dinamički veže na hromatin, glavnim putem udruživanja sa kohezinom. Kretanje NiPBL-a unutar hromatina u skladu je sa mehanizmom koji uključuje skakanje između hromosomkog koheziranja prstenova. Pokazana je i kohezina nezavisna regulacijia ekspresija odgovornog gena.
Klinički značaj
Mutacije u ovom genu rezultiraju sindromom Cornelije de Lange (CDLS), poremećaj koji karakterizira dismorfne karakteristike lica, kašnjenje rasta, smanjenje dužine udova i mentalna invalidnost kao što su ove mutacije. Obično su heterozigotni CD-ovi pogođeni smanjenjem NiPBL-a nije potpuni gubitak. Eksperimenti na ćelijama pacijenata i miševa pokazuju da je smanjenje za manje od polovine. Nije poznato zašto se javlja smanjenje ekspresije NIPBL u CDL-ovima.
Reference
Kategorija:Geni na hromosomu 5 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika