Lipid A-deacilaza (PagL) je protein vanjske membrane sa lipid A 3-O-deacilaznom aktivnošću. Formira 8-lančanu beta bačvastu strukturu. Patogene Gram-negativne bakterije mogu modificirati dio lipida A svog lipopolisaharida, kao odgovor na podražaje iz okoline. 3-O-deacilacija lipida A pomoću enzima PagL vanjske membrane modulira signalizaciju putem Toll-likog receptora 4, što dovodi do smanjenog imunskog odgovora domaćina. Otkriveno je da je PagL široko rasprostranjen među gram-negativnim bakterijama.
Konzervirana su samo četiri ostatka: ostatak Ser, His, Phe i Asn. Opisana je kristalna struktura PagL iz Pseudomonas aeruginosa do rezolucije od 2,0 Å. Sastoji se od osmolančane β-bureta s osom nagnutom za ≈30° u odnosu na lipidni dvosloj. Struktura otkriva da PagL sadrži aktivno mjesto sa katalitskom trijadom Ser-His-Glu i oksianionskom rupom koja sadrži konzervirani Asn. Važnost ostataka aktivnog mjesta potvrđena je u studijama mutageneze. Iako je PagL najvjerovatnije aktivan kao monomer, arhitektura njegovog aktivnog mjesta pokazuje veliku sličnost sa dimernom 12-lančanom fosfolipazom-A vanjske membrane. Modeliranje supstratnog lipida X na aktivnom mjestu otkriva da je 3-O-acilni lanac smješten u hidrofobnom žlijebu okomitom na ravan membrane. Osim toga, aspartat formira vodikovu vezu sa hidroksilnom grupom 3-O-acilnog lanca, vjerovatno pružajući specifičnost PagL prema lipidu A.
Reference
Kategorija:Proteinski domeni Kategorija:Proteinske porodice Kategorija:Membranski proteini