La troisième guerre civile centrafricaine est un conflit inter-communautaire apparu au cours de l'année 2013 en République centrafricaine.
Elle oppose notamment les milices de la Seleka, à majorité musulmane et fidèle au président Michel Djotodia, à des groupes d'auto-défense chrétiens et animistes, les anti-balaka, fidèles à l'ancien président François Bozizé et accusés d'être soutenus par des anciens militaires des Forces armées centrafricaines.
Le conflit se caractérise par de nombreuses exactions contre les civils, musulmans ou chrétiens. Un grand nombre d'entre eux fuient les villages pour se réfugier dans la brousse. La situation débouche sur une crise humanitaire importante, aggravée par le chaos sécuritaire.
Le , alors que de violents combats éclatent à Bangui et Bossangoa, une résolution de l'ONU autorise le déploiement de la MISCA, appuyée par la France afin d'intervenir pour stabiliser la situation.
Le , les belligérants signent un accord de cessation des hostilités à Brazzaville. Le calme, tant à Bangui que dans le reste du pays, reste toutefois précaire.
Contexte thumb|left|upright=1.3|Un blindé Panhard AML (Eland) tchadien de la FOMAC, le , à Bangui.
À la suite de la victoire militaire de Michel Djotodia sur François Bozizé en à l'issue de la deuxième guerre civile centrafricaine, la stabilité n'est pas revenue dans le pays. Les combats entre milices d'autodéfense appelées anti-balaka (« antimachettes ») et les troupes de la Seleka se multiplient à partir d' et l’État ne semble plus en mesure de faire régner l'ordre. La force multinationale de l'Afrique centrale déployée par la Communauté économique des États de l'Afrique centrale pour aider à sécuriser la région est dépassée.
Le , par la résolution 2127, le conseil de sécurité des Nations unies autorise le officiellement pour mettre fin à la .. La MISCA est appuyée par des forces françaises autorisées à prendre .
Déroulement Violences des Seleka vignette|gauche|Forces anti-balaka à Bossangoa, le 15 octobre 2013.
Entre mars et , de très nombreuses exactions sont commises par les membres de la Seleka, milice musulmane. Human Rights Watch, présent sur place, chiffre à un millier le nombre de maisons ou habitations détruites, et dénombre des dizaines de victimes. Un total de 34 villages comme Bogoro, Bobafio, Kadi ou Gbadene ont été entièrement brûlés.. Plusieurs dizaines de cas de viols ont été recensés..
Le , la Seleka tue 17 habitants du quartier Damala, de Bangui. Le , une voiture de la Seleka fonce dans un cortège funèbre, déclenchant de la part de la foule des hostilités avant que les miliciens n'ouvrent le feu, tuant 18 civils. Les 13 et , les membres de la Seleka investissent le quartier de Boy-Rabé, majoritairement chrétien, tuant 28 personnes dont des enfants. Le , voulant réquisitionner de force un camion, des miliciens abattent l'épouse et l'enfant de 8 mois du chauffeur. Courant avril, des habitants découvrent les corps de nombreux membres des Forces armées centrafricaines, exécutés. Le , 12 personnes tentant de fuir sont abattues sur la route de Bossangoa-Boguila.
En , Claude Guéant est reçu par Djotodia à Bangui..
Début , une vingtaine d’employés d’une société de sécurité privée prennent en charge la protection rapprochée de Djotodia."Sécurité : des retraités français très spéciaux débarquent en Centrafrique", Jeune Afrique, 17/07/2013 . Jérôme Gomboc, commande cette petite armée privée au camp Roux, à Bangui, pour le compte de la société Roussel, basée à Fréjus. Selon Jeune Afrique, l’ambassade de France à Bangui ne parvient pas à convaincre le président Djotodia de les renvoyer, la société Roussel G-Sécurité, étant immatriculée dans l’État du Delaware, aux États-Unis.
Le Jean-Christophe Mitterrand rend visite au président centrafricain putchiste Djotodia. Parmi ses accompagnateurs figurent l’homme d’affaires Ibrahim Aoudou Paco connecté aux milieux miniers, ex-député de la ville diamantifère de Carnot, Emile Gros Raymond Nakombo, ex-directeur général adjoint de la Banque populaire maroco-centrafricaine (BPMC) et candidat à la présidentielle de 2011 pour le Rassemblement démocratique de Centrafrique (RDC) d’André Kolingba, et le linguiste centrafricain Marcel Diki-Kidiri..
Début août Gomboc est nommé conseiller spécial chargé de la sécurité du président de la transition Djotodia..
Le , 2 membres d'une ONG française sont tués, probablement par des membres de la Seleka. Devant les critiques, le président par intérim, Michel Djotodia, déclare dissoudre la coalition Seleka, mais la majorité des miliciens refusent de désarmer.
L'insurrection anti-balaka Début , des villageois, excédés par les exactions de la Seleka, créent des milices d'auto-défense, les anti-balaka. Ils sont surtout concentrés dans la région de Bossangoa, ancien fief du président Bozizé.. Le , ces milices attaquent des bases de la Seleka et des communautés musulmanes, tuant plusieurs dizaines de personnes.. Ces premières attaques ont lieu notamment à Zéré.. Des réfugiés commencent à arriver à Bossangoa le . Le 15, ils sont à être réunis sur les terrains de l'archevêché. Le , des heurts à Bouca sont provoqués par une attaque d'anti-balaka. Une quarantaine de musulmans sont tués, 250 maisons brûlées. En représailles, la Seleka investit à son tour la ville, tuant une trentaine de chrétiens, et détruisant 300 maisons.
Début octobre, à quelques jours de la visite de Laurent Fabius, les agents de sécurité français engagés par Michel Djotodia, le président de la transition, quittent la Centrafrique. Nommé en août conseiller spécial chargé de la sécurité du président de la transition, Gomboc reste pour sa part à Bangui.
Le , des miliciens anti-balaka attaquent la ville de Bouar où sont présents des membres de la Seleka. Les combats font 5 morts chez ces derniers, et 6 miliciens anti-balaka. Deux membres de la Seleka visent une maison où se seraient retranchés des anti-balaka, tuant en réalité 18 civils et en blessant 12 autres.
Le , les forces de la Seleka incendient le village de Camp Bangui, détruisant 235 habitations..
Le , des anti-balaka attaquent des éleveurs peuls musulmans, tuant une douzaine d'entre eux dont des enfants. Plusieurs civils sont tués en représailles par la Seleka.
Le , les milices anti-balaka prennent part à la bataille de Bangui, épaulés par des anciens membres des Forces armées centrafricaines. Selon Amnesty International, les Anti-Balaka tuent environ 60 hommes musulmans. Par la suite les hommes de la Seleka tuent en représailles environ en deux jours, dont quelques femmes et enfants. Des exactions se poursuivent les jours suivants, au moins 90 personnes sont assassinées entre le 8 et le ..
Des combats ont aussi lieu à Bossangoa.. Déclenchement de l'opération Sangaris et déploiement de la MISCA
thumb|upright=1.3|Soldats Burundais de la MISCA, le , à Bangui.
À la suite de l'adoption à l'unanimité de la résolution du conseil de sécurité des Nations unies, la France annonce, le , l'envoi de pour rétablir la sécurité dans le pays dans le cadre de l'Opération Sangaris. et le conseil de sécurité des Nations unies décide la mise en place de la mission internationale de soutien à la Centrafrique sous conduite africaine (MISCA).
Fin , les civils tchadiens fuient Bangui, la capitale de la Centrafrique. En effet, le Tchad et son président Idriss Déby sont considérés comme des « faiseurs de roi » dans cette partie de l'Afrique, et ont successivement soutenu François Bozizé pour emporter la présidence centrafricaine en 2003 puis Michel Djotodia et la rébellion de la Séléka (musulmane) en 2013, que de nombreuses exactions contre les civils centrafricains (chrétiens) ont rendu impopulaires..
Selon une enquête de Human Rights Watch, le , à Bossangoa, des soldats de la République du Congo arrêtent trois chefs anti-balaka, ce qui provoque la colère de plusieurs réfugiés qui menacent un soldat congolais isolé. Celui-ci tue un jeune homme mais est ensuite lynché à mort par la foule. En représailles des soldats congolais torturent à mort deux des chefs anti-balaka, le troisième ayant entre-temps été libéré à la demande des Français...
Le conflit s'étend thumb|left|upright=1.3|Soldats français de l'Opération Sangaris, le , à Bangui.
Le , le président de la transition centrafricaine Michel Djotodia et son premier ministre Nicolas Tiangaye annoncent leur démission lors d'un sommet extraordinaire de la communauté économique des États de l'Afrique centrale (CEEAC)...
Le , le conseil national de transition de la République centrafricaine élit Catherine Samba-Panza comme Chef de l'État de transition de la République centrafricaine..
En janvier le mouvement Révolution et Justice et branche armée ; les Forces Spéciales de Révolution Justice (FS-RJ), dirigé par le commandant Sayo attaque la Seleka dans le nord-ouest du pays. Le mouvement publie plusieurs communiqués dans lequel il prétend avoir remporté plusieurs combats contre les Seleka. Selon eux, le , ils battent les Seleka entre Boguila et Goré.. Le 19, un nouvel affrontement a lieu à Sido, entre Markounda et Bossangoa.. Le 22, les FS-RJ déclarent avoir tué 22 combattants des Seleka à Boguila après des combats de deux jours contre aucune perte dans leurs rangs, puis s'être emparé de Bodjomo...
Plusieurs massacres sont commis en janvier. Selon un rapport d'Amnesty International publié le , les massacres commis par les anti-balaka contre les musulmans font environ 30 morts à Boyali le , cinq à Boali le 17, au moins 43 à Bossemptélé du 16 au , plus de 100 à Bossembélé le . De leurs côtés, les Selekas massacrent 24 chrétiens à Bata le , puis plus de 100 autres à Baoro le .. Le 29 des affrontements à Boda font au moins 84 morts dans les deux camps selon la Croix Rouge..
En février des anti-balaka assassinent 72 hommes à Guen, non loin dans un autre village les Séléka tuent 19 personnes.
Le , un soldat français est tué à Bouar, dans un accident de la route. Deux autres soldats à bord du VBL sont blessés..
Le , des soldats congolais de la MISCA repoussent une attaque d'anti-balaka. L'affrontement fait un mort du côté des Congolais, douze chez les assaillants.. Mais selon Human Rights Watch après ce combat, les soldats de la République du Congo capturent 11 à 18 civils, dont au moins quatre femmes, qui sont probablement exécutés par la suite.
Le , après un incident à Bangui qui fait plusieurs morts, le Tchad annonce le retrait de ses forces de la République centrafricaine, dénonçant ..
Le , des affrontements à Dékoa entre Seleka et anti-balaka font au moins 37 morts..
Du 13 au , des combats à Grimari entre Seleka et Anti-Balaka font plusieurs dizaines de morts.. Les Français interviennent mais ils sont attaqués le 20 par une vingtaine d'Anti-Balaka, les militaires répliquent et tuent cinq assaillants..
Le , un groupe de Seleka attaque Boguila après avoir assassiné plusieurs personnes en chemin. Les rebelles tuent 16 personnes dans l'hôpital, dont trois employés de Médecins sans frontières. Ils se replient ensuite sur Bémal...
Le , Markounda est attaquée par des rebelles Peuls qui tuent , prennent alors la fuite et se réfugient à Komba, au Tchad... Au début du mois, d'autres violences à Paoua font au moins 55 morts..
Entre le et le , des affrontements ont également lieu à Mala entre Seleka et Anti-Balaka, faisant au moins 30 morts et environ 10 blessés..
Après ces violences, les forces françaises de l'Opération Sangaris lancent une mission de reconnaissance entre Bossangoa et Paoua. Mais le , à Boguila, les Français sont attaqués par un groupe d'une quarantaine d'hommes armés qui feraient peut-être parti des Seleka venus de Bémal. L'attaque est repoussée après trois heures de combats et 10 à 15 assaillants sont tués. Les Français ne déplorent ni mort ni blessé......