Le footprint ou footprinting de l'ADN est une technique de biologie moléculaire permettant l'identification des protéines et facteurs de transcription se fixant sur une séquence de l'ADN.

Méthode Cette technique se fait en plusieurs étapes : Amplification d'ADN par PCR, Marquage du 5' d'un des deux brins de l'ADN Incubation de l'ADN amplifié avec des protéines d'intérêt, Digestion ménagée par une enzyme de type DNAse I (en présence de Ca2+. La réaction sera stoppée avec de l'EDTA (un chélateur de cations permettant d'inhiber et donc de stopper le travail de la nucléase), Analyse de la longueur des fragments (réalisée par des automates séquenceurs), Analyse du gel (de polyacrylamide) en conditions dénaturantes (présence de sodium dodécyl sulfate, par exemple)..

Notes et références 2. http://www.biology-pages.info/F/Footprinting.html

Voir aussi Réaction en chaîne par polymérase Western blot Footprinting

Catégorie:Technique de biologie moléculaire