vignette|Logo d'Entrez Le système global de recherches inter-bases de données Entrez (en anglais Entrez ) permet d'accéder à des bases de données du site internet du (NCBI). Le NCBI fait partie de la (NLM), qui est elle-même un département des (NIH) du gouvernement des États-Unis.
Recherches
Entrez est un moteur de recherche puissant qui peut être utilisé pour toutes les bases de données alimentées par le NCBI. Ces bases sont : Medline : articles provenant de revues scientifiques, principalement des revues médicales. Elle propose souvent un résumé. Des liens vers PubMed Central et d’autres ressources en plein texte sont fournies depuis les années 1990 PubChem, une base de données des complexes chimiques et de substances et leurs structures chimiques, propriétés et bioactivité PubMed : citations et résumés de la littérature biomédicale, dont Medline. Liens vers PubMed Central et d‘autres ressources en texte intégral. PubMed Central : articles en accès libre Site Search : réseau NCBI et sites FTP Books : livres en ligne Héritage mendélien chez l'humain (OMIM pour l’acronyme anglophone) Nucleotide: base de données de séquences (GenBank) Protein: base de données de séquences (GenPept) Genome : séquençage de génomes et séquençage du génome humain Structure : structures macro-moléculaires tri-dimensionnelles Taxonomy: organismes dans la GenBank Taxonomy dbSNP: single nucleotide polymorphism Gene: gene-centered information HomoloGene : groupes d‘homologies chez les Eucaryotes PubChem Compound : structures chimiques des petites molécules PubChem Substance : données sur les substances chimiques enregistrées Projet de séquençage de génome : information sur le projet génome PopSet : épidémiologie Cancer Chromosomes : bases de données cytogénétiques NLM Catalog : données bibliographiques de NLM sur plus d’ de revues, livres, vidéos, logiciels, ressources électroniques et d’autres matériaux hébergés par LocatorPlus (mise à jour chaque jour de la semaine).
Entrez peut fournir des vues des séquences génétiques et de protines et des cartes de chromosomes. Entrez peut retrouver efficacement des séquences, des structures et des références analogues. Certains manuels sont aussi disponibles via Entrez. Entrez Global Query est un système intégré de recherche et de récupération de données qui donne accès à toutes ces bases de données simultanément.
Bases de données Entrez permet de faire une recherche globale ou filtrée dans les bases de données suivantes :
: recherche dans toutes les bases de données ci-dessous NCBI : NCBI FTP PubMed : littérature scientifique et biomédicale avec le plus souvent accès aux résumés (en ). La consultation de l'article intégral est également possible pour certains journaux lorsqu'un lien a été établi avec l'éditeur. : recherche de séquences de protéines : recherche de séquences de nucléotides (GenBank) EST : GSS : Structure : structures macromoléculaires en 3D Genome : séquences complètes de génomes Mapping : voies métaboliques et systèmes biologiques : livres en ligne CancerChromosomes : aberrations cytogénétiques des cancers : domaines conservés des protéines 3D : domaines de protéines en 3D : modifications qui contrôlent l'expression des gènes Gene : information complète sur les gènes : informations issues du dbGAP : génotypes et phénotypes () dbVar : variations structurelles de l'ADN (inversions, translocations, insertions et délétions) GENSAT : atlas d'expression de gènes du système nerveux central de la souris GEO : profils d'expression de gènes HomoloGene : séquences homologues chez des groupes eucaryotes Images : images, figures et tableaux provenant des articles déposés dans PubMed Central MeSH : Catalogue des descripteurs () NLM Catalog : données bibliographiques de la bibliothèque Nationale de Médecine américaine (NLM) OMIM : transmission mendelienne chez l'homme OMIA : transmission mendelienne chez l'animal Peptidome : données d'identification de peptides et de protéines par spectrographie de masse en tandem PMC : Pubmed Central, sous-ensemble de PubMed comportant l'intégralité des articles accessibles librement PopSet : données sur l'étude des populations (épidémiologie) : séquences spécifiques pour sondes moléculaires
PubChem : bio-activité des substances chimiques PubChem : activité biologique et structure chimique de composés uniques PubChem Substance : activité biologique et structure chimique de composés complexes SNP : polymorphismes nucléotidiques simples SRA : données issues du séquençage de dernière génération [ (SRA)] Taxonomy : organismes dans GenBank Taxonomie UniGene : groupe de séquences transcrites issues d'un même gène UniSTS : séquences uniques de l'ADN dont la localisation est la position sont connues
Genbank
Catalogue NLM
Références
Voir aussi Article connexe Ressources en chimie
Lien externe Formulaire du moteur de recherche Entrez
Catégorie:Base de données bioinformatiques