Le virus WIV16 est une souche de coronavirus associé au SRAS (espèce SARSr-CoV).
Son génome, publié en 2016, a une similitude de 96 % avec la séquence entière du génome du SRAS-CoV-1 responsable l'épidémie de SRAS.
Comme le SARS-CoV et le SARS-CoV-2, il utilise l'ACE2 comme récepteur pour infecter les cellules.
Découverte Le virus WIV16 a été découvert et isolé avec succès en 2013 dans les échantillons fécaux de la chauve-souris Rhinolophus sinicus à Kunming dans le Yunnan.
Virologie La longueur du génome est de 30290 bases et sa similarité de séquence avec le SRAS-CoV-1 est de 96 % (contre 95,6 % pour le virus WIV1 et 95,4 % pour le virus SHC014), ce qui en fait le virus connu le plus proche du SRAS-CoV-1. En particulier, sa protéine spiculaire présente une similitude de séquence d'acides aminés de 97 % avec le SRAS-CoV-1, ce qui est supérieur aux autres SRASr-CoV de chauve-souris connus. Comme le WIV1, la similitude au niveau du domaine de liaison au récepteur (RBD) est de 95 %.
En revanche, sa similarité est plus faible, au niveau de la séquence ORF8 (environ 40 %).. Le virus WIV16 et le virus WIV ont tous deux un autre cadre de lecture ouvert entre ORF6 et ORF7. ORFX code une protéine auxiliaire, qui est unique à ces deux souches virales et peut inhiber l'interféron β dans les cellules hôtes et stimuler l'expression de NF-κB (réponse immunitaire).
Parmi les virus de chauve-souris liés au SRAS, seuls les virus WIV16 et WIV1 ont été isolés avec succès à partir d'échantillons et cultivés dans des cellules in vitro.
Position phylogénétique
Références
Catégorie:Betacoronavirus pandemicum Catégorie:Virus transmis par des chauves-souris