De nouvelles espèces biologiques sont régulièrement définies chaque année. L'apparition d'une nouvelle espèce dans la nomenclature peut se faire de trois manières principales : découverte dans la nature d'une espèce totalement différente de ce qui est connu jusqu'alors, nouvelle interprétation d'une espèce connue qui s'avère en réalité être composée de plusieurs espèces proches mais bien distinctes. Ce mode d'apparition d'espèce est en augmentation depuis qu'il est possible d'analyser très finement le génome par des méthodes d'étude et de comparaison des ADN, ces méthodes aboutissant par ailleurs à des remaniements de la classification par une meilleure compréhension de la parenté des taxons (phylogénie). Pour ce type de création de nouvelles espèces, deux circonstances sont possibles : soit une sous-espèce déjà définie est élevée au statut d'espèce, auquel cas le nom, l'auteur et la date sont conservés, soit il est nécessaire de donner un nouveau nom à une partie de la population de l'ancienne espèce, découverte d'une nouvelle espèce par l'étude plus approfondie des spécimens conservés dans les musées et les collections.

Ces trois circonstances ont en commun d'être soumises au problème du nombre de spécialistes mondiaux compétents capables de reconnaître le caractère nouveau d'un spécimen. C'est une des raisons pour lesquelles le nombre d'espèces nouvelles chaque année, dans une catégorie taxinomique donnée, est à peu près constant.

Pour bien préciser le nom complet d'une espèce, le (ou les) auteur(s) de la description doivent être indiqués à la suite du nom scientifique, ainsi que l'année de parution dans la publication scientifique. Le nom donné dans la description initiale d'une espèce est appelé le basionyme. Ce nom peut être amené à changer par la suite pour différentes raisons.

Dans la mesure du possible, ce sont les noms actuellement valides qui sont indiqués, ainsi que les découvreurs, les pays d'origine et les publications dans lesquelles les descriptions ont été faites.

2001 Espèces décrites en 2001 Rongeurs Porc-épic des Roosmalen (Sphiggurus roosmalenorum (Voss et da Silva, 2001)) Eréthizontidé découvert au Brésil par les Roosmalen père et fils en 1996, d'où son épithète spécifique Basionyme : Coendou roosmalenorum (►Wikispecies). Sphiggurus ichillus (Voss et da Silva, 2001)) Eréthizontidé découvert en Équateur (►Wikispecies) Basionyme : Coendou ichillus. Ctenomys lami, 2001 Découvert au Brésil. Eliurus antsingy Carleton, Goodman et Rakotondravony, 2001 Nésomyidé découvert à MadagascarProceedings of the Biological Society of Washington 114 (4) : 972-987.. Thomasomys reigi Ochoa et al., 2001 Rongeur découvert au Venezuela. Neacomys dubosti Voss, Lunde et Simmons, 2001 Découvert en Guyane française, Surinam et Brésil. Neacomys paracou Voss, Lunde et Simmons, 2001 Découvert en Guyane française, Venezuela, Guyana, Surinam et Brésil. Spalax carmeli Nevo et al., 2001 Découvert en Israël. Spalax galili Nevo et al., 2001 Découvert en Israël. Spalax golani Nevo et al., 2001 Spalax judaei Nevo et al., 2001 Découvert en Israël.

Lagomorphes Sylvilagus varynaensis Durant et Guevara, 2001 Léporidé découvert au Venezuela.

Chiroptères thumb|Murin d'Alcathoé (Myotis alcathoe).

Myotis (Leuconoe) annamiticus Kruskop et Tsytulina, 2001 Vespertilionidé découvert au Vietnam. Myotis alcathoe, 2001 Découvert en Europe. Sturnira mistratensis, 2001 Découvert en Colombie. Glauconycteris curryae, 2001 Découvert en Afrique. Carollia colombiana, 2001 Découvert en Colombie. Paranyctimene tenax Bergmans, 2001 Saccopteryx antioquensis Muñoz et Cuartas, 2001

Macrochiroptères Paranyctimene tenax (Bregmans, 2001) Ptéropodidé.

Xénarthres Bradypus pygmaeus Anderson et Handley, 2001 Découvert dans l'île Escudo au Panama. Population antérieurement confondue avec Bradypus variegatus Proceedings of the Biological Society of Washington, 114 (1) : 1-33..

Accession au statut d'espèce (2001) Proboscidiens Eléphant africain de forêt (Loxodonta cyclotis (Matschie, 1900)) Antérieurement considéré comme une sous-espèce de l'éléphant d'Afrique (Loxodonta africana cyclotis). Reconnu comme une espèce à part entière, sur des bases génétiquesRoca, Georgiadis, Pecon-Slattery et O'Brien, Science, 24 : 1414 (août 2001)..

Espèces fossiles (2001) Primates Kenyanthropus platyops Leakey (M.G.), Spoor, Brown, Gathogo, Kiarie, Leakey (L.N.) et McDougall, 2001 Hominidé découvert par Justus Erus en 1999Nature 410 : 433-440 (22 mars 2001).. Orrorin tugenensis Senut, Pickford, Gommery, Mein, Cheboi et Coppens, 2001 Hominidé découvert en 2000 dans les monts Tugen au KenyaComptes-rendus de l'Académie des Sciences 332 : 137-144.. Périssodactyles Kalimantsia bulgarica Geraads, Spassov et Kovachev, 2001 Chalicothériidé. Cétartiodactyles Paracamelus minor Logvynenko, 2001 Camélidé découvert dans le Pliocène d'Ukraine Vestnik zoologii 35 (1) : 39-42.. Amphirhagatherium edwardsi Hooker et Thomas, 2001 Choeropotamidé. Krabimeryx primitivus Métais, Chaimanee, Jaeger et Ducrocq, 2001 Lophiomérycidé. Archaeotragulus krabiensis Métais, Chaimanee, Jaeger et Ducrocq, 2001 Tragulidé. Parachleuastochoerus sinensis Pickford et Liu, 2001 Suidé. Listriodon bartulensis Pickford, 2001 Suidé. Parmularius pachyceras Geraards, Brunet, Mackaye et Vignaud, 2001 Bovidé.

Sous-espèces vivantes nouvelles (2001) Insectivores Solenodon paradoxus woodi, 2001 Chiroptères Plecotus macrobullaris alpinus Kiefer et Veith, 2001 Oreillard découvert dans les Alpes, redécrit en 2002 par Spitzenberger, Haring et Tvrtkovic sous le nom de Plecotus microdontus (synonyme)

Sous-espèces fossiles nouvelles (2001) Carnivores Lion de Béringie (Panthera spelaea vereshchagini (Baryshnikov & Boeskorov, 2001)) Félidé découvert dans l'Arctique sibérien et nord-américain.

Cétartiodactyles Cervus elaphus rossii Pereira, 2001 Endémique du Pleistocène de Corse.

2002 Espèces décrites en 2002 Primates Titi du Prince Bernhard (Callicebus bernhardi) M.G.M. van Roosmalen, T. van Roosmalen et Mittermeier, 2002 Découvert au Brésil Callicebus stephennashi M.G.M. van Roosmalen, T. van Roosmalen et Mittermeier, 2002 Découvert au Brésil Sahelanthropus tchadensis, 2002

Cétartiodactyles Mesoplodon perrini Dalebout, Mead, Baker, Baker and van Helden, 2002 Ziphiidé Insectivores Congosorex verheyeni Hutterer et al., 2002 Soricidé découvert en Afrique (République du Congo et République Centrafricaine). Cryptotis tamensis, 2002 Découvert au Venezuela.

Chiroptères Plecotus microdontus Spitzenberger, Haring et Tvrtković, 2002 VespertilionidéNatura Croatica 11 (1) : 1-18.. Oreillard sarde (Plecotus sardus Mucedda, Kiefer, Pidinchedda et Veith, 2002) Carollia sowelli, 2002 Découvert en Amérique centrale. Rhinolophus sakejiensis Cotterill, 2002 Découvert en ZambieJournal of Zoology, London256 : 165-179.. Rhinolophus ziama, 2002 Découvert en Afrique. Nyctophilus nebulosus Parnaby, 2002 Microchiroptère vespertilionidé découvert en Nouvelle-Calédonie en et décrit en 2002Australian Mammalogy 23 : 115-124.. Micronycteris matses, 2002 Découvert en Amazonie péruvienne.

Macrochiroptères Pteropus banakrisi Richards et Hall, 2002 Roussette (Ptéropodidés) découverte au Queensland (Australie). Pteralopex taki Parnaby, 2002 Roussette de Nouvelle-Géorgie (îles Salomon)

Marsupiaux Trichosurus cunninghami Lindenmayer, Dubach et Viggers, 2002 Marsupial phalangéridé de l'État de Victoria (Australie) Cryptonanus ignitus Diaz et al., 2002 Marsupial didelphidé.

Rongeurs Abrocoma uspallata Braun et Mares, 2002 Rongeur découvert en Argentine. Un seul spécimen connu, collecté en 1995. Heteromys teleus Anderson & Jarrin, 2002 Hétéromyidé découvert en Équateur. Habromys delicatulus, 2002 Découvert au Mexique. Microtus anatolicus Krystufek & Kefelidglu, 2002 Cridétidé. Trinomys mirapitanga Lara, Patton et Hingst-Zaher, 2002 Rongeur échimyidé découvert dans l'État de Bahia, au Brésil. Phyllomys pattoni Emmons, Leite, Kock et Costa, 2002 Rongeur échimyidé découvert au Brésil. Sommeromys macrorhinos Musser et Durden, 2002 Découvert aux Sulawesi (Indonésie). Gerbillus rupicola Granjon, Aniskin, Volobouev et Sicard, 2002 Rongeur découvert au MaliJournal of Zoology, 2002.. Synonyme : Dipodillus rupicola Cerradomys maracajuensis (Langguth et Bonvicino, 2002) Rongeur découvert au Paraguay. Décrit initialement sous le nom dOryzomys maracajuensis.Cerradomys scotti (Langguth et Bonvicino, 2002) Rongeur découvert au Brésil. écrit initialement sous le nom dOryzomys scotti.Juliomys rimofrons, 2002 Découvert au Brésil.Bullimus gamay, 2002 Découvert aux Philippines.Lophuromys dudui, 2002 Découvert en Afrique.Lophuromys verhageni, 2002.Thomasomys onkiro Luna et Pacheco, 2002 Rongeur découvert au Pérou.

Sous-espèces élevées au rang d'espèce ou espèces réhabilitées (2002) CétartiodactylesMesoplodon traversii (Gray, 1874) Cétacé ziphiidé. Le spécimen décrit en 1995 sous le nom de Mesoplodon bahamondi appartient en réalité à ce taxon décrit par Gray en 1874 à partir d'un spécimen découvert en 1872.Babyrousa togeanensis Sody, 1949 Suidé des îles Togian (Indonésie) auparavant considéré comme une sous-espèce de Babyrousa babyrussa Meijaard & Groves, Upgrading three subspecies of babirusa (Babyrousa sp.) to full species level, Asian Wild Pig News 2 (2) : 33-39 (2002).. Babyrousa celebensis Deninger, 1909 Suidé se Sulawesi (Indonésie) auparavant considéré comme une sous-espèce de Babyrousa babyrussa .

Sous-espèces nouvelles (2002) InsectivoresCrocidura rapax lutaoensis, 2002 ChiroptèresBarbastella barbastellus guanchae Trujillo, Ibáñez et Juste, 2002 Découverte aux Canaries.

PrimatesHapalemur griseus ranomafanensis Rumpler, Hauwy, Rabarivola, Rakotoarisoa et Dutrillaux, 2002 Découvert à MadagascarChromosome Research 10 : 145-153.. RongeursMicrotus lydius ankarensis, 2002

CétartiodactylesOzotoceros bezoarticus arerunguaensis, 2002Ozotoceros bezoarticus uruguayensis, 2002

Espèces fossiles et subfossiles (2002) ChiroptèresTachypteron franzeni Storch, Sigé et Habersetzer, 2002 Emballonuridé découvert dans l'Éocène de Messel en Allemagne. PrimatesAustralopithecus anamensis Leakey et al., 2002 Hominidé découvert au Kenya en 1988.Sahelanthropus tchadensis Brunet et al., 2002 Hominidé découvert au Tchad.Homo georgicus Vekua, Lordkipanidze, Rightmire, Agusti, Ferring, Maisuradze et al., 2002 Hominidé découvert en Géorgie A new skull of early Homo from Dmanisi, Georgia, Science, 297 : 85-89.. XénarthresThalassocnus carolomartini (Thalassocnus) McDonald et de Muizon, 2002 Xenarthre nothrothériidé.Acratocnus simorhynchus Rega, McFarlane, Lundberg et Christenson, 2002 Xenarthre Mégalonychidé découvert dans la Wisconsinien de République DominicaineCaribbean Journal of Science, 36 (1-2) : 11-19..

CétartiodactylesIsanacetus laticephalus Kimura et Ozama, 2002 Cétacé mysticète découvert dans le Miocène du Japon«A new cetothere (Cetacea: Mysticeti) from the Early Miocene of Japan», Paleontology, 22 (3) : 684-702..Simocetus rayi Fordyce, 2002 Simocétidé découvert dans l'Oligocène de l'Orégon.Babyrousa bolabatuensis Hooijer, 1950 Suidé de Sulawesi (Indonésie) auparavant considéré comme une sous-espèce de Babyrousa babyrussa . Hyotherium shanwangense Liu, Fortelius et Pickford, 2002 Suidé.Sinapriculus linquensis Liu, Fortelius et Pickford, 2002 Suidé.

2003 Espèces décrites en 2003 MarsupiauxMicroperoryctes aplini (Helgen et Flannery, 2003) Marsupial péramélidé découvert en Papouasie-Nouvelle-Guinée. InsectivoresHylomys megalotis, 2003Chodsigoa caovansunga Lunde, Musser et Nguyen, 2003 Insectivore soricidé découvert au VietnamA survey of small mammals from Mt Tay Con Linh Il, Vietnam, with the description of a new species of Chodsigoa (Insectivora :Soricidae), Mammal Study 28 : 31-46..Cryptotis brachyonyx Woodman, 2003 Soricidé découvert en Colombie.

ChiroptèresHipposideros scutinares Robinson, Jenkins, Francis et Fulford, 2003 Rhinolophidé découvert au Laos et au Vietnam.Rousettus linduensis, 2003 Découvert aux Sulawesi (Indonésie).