De nouvelles espèces vivantes sont régulièrement définies chaque année.
L'apparition d'une nouvelle espèce dans la nomenclature peut se faire de trois manières principales : découverte dans la nature d'une espèce totalement différente de ce qui est connu jusqu'alors, nouvelle interprétation d'une espèce connue qui s'avère en réalité être composée de plusieurs espèces proches mais cependant bien distinctes. Ce mode d'apparition d'espèce est en augmentation depuis qu'il est possible d'analyser très finement le génome par des méthodes d'étude et de comparaison des ADN, ces méthodes aboutissant par ailleurs à des remaniements de la classification par une meilleure compréhension de la parenté des taxons (phylogénie). Pour ce type de création de nouvelles espèces, deux circonstances sont possibles : soit une sous-espèce déjà définie est élevée au statut d'espèce, auquel cas le nom, l'auteur et la date sont conservés, soit il est nécessaire de donner un nouveau nom à une partie de la population de l'ancienne espèce, découverte d'une nouvelle espèce par l'étude plus approfondie des spécimens conservés dans les musées et les collections.
Ces trois circonstances ont en commun d'être soumises au problème du nombre de spécialistes mondiaux compétents capables de reconnaître le caractère nouveau d'un spécimen. C'est une des raisons pour lesquelles le nombre d'espèces nouvelles chaque année, dans une catégorie taxinomique donnée, est à peu près constant.
Pour bien préciser le nom complet d'une espèce, le (ou les) auteur(s) de la description doivent être indiqués à la suite du nom scientifique, ainsi que l'année de parution dans la publication scientifique. Le nom donné dans la description initiale d'une espèce est appelé le basionyme. Ce nom peut être amené à changer par la suite pour différentes raisons.
Dans la mesure du possible, ce sont les noms actuellement valides qui sont indiqués, ainsi que les découvreurs, les pays d'origine et les publications dans lesquelles les descriptions ont été faites.
2001 Espèces vivantes décrites en 2001 Tortues Platémyde à tête jaune de l'Amazone (Mesoclemmys heliostemma McCord, Joseph-Ouni et Lamar, 2001) Tortue de la famille des chélidés découverte en Amérique du sud. Lézards Varanus macraei Böhme et Jacobs, 2001 Varanidé. Varanus mabitang Gaulke et Curio, 2001 Varanidé. Sphaerodactylus ariasae Hedges et Thomas, 2001 Geckonidé découvert dans les Antilles (île Beata et région voisine de l'île d'Haïti, en République Dominicaine. Depuis sa découverte, cette espèce est devenue le plus petit vertébré du monde (14 à 18 mm.) Caribbean Journal of Science 37, n° 3-4 pp. 168-173.. Calyptommatus confusionibus Rodrigues et al., 2001 Gymnophthalmidé découvert dans le parc national Confusões, dans l'État de Piauí au Brésil. Cyrtodactylus irianjayaensis Rössler, 2001 Gekkonidé découvert en Indonésie. Phelsuma hielscheri Rössler, Obst et Seipp, 2001 Gecko découvert dans l'ouest de Madagascar. Paroedura lohatsara, Glaw et al., 2001 Liolaemus grosseorum Etheridge, 2001 Liolémidé découvert en Argentine Anolis hobartsmithi Nieto-Montes de Oca, 2001 Polychrotidé découvert au Mexique. Anolis ocelloscapularis Köhler, McCranie & Wilson, 2001 Polychrotidé découvert au Honduras. Anolis oporinus, 2001 Polychrotidé découvert à Cuba. Anolis roatanensis, 2001 Polychrotidé découvert dans l'île de Roatán, au Honduras. Anolis terueli, 2001 Polychrotidé. Anolis wampuensis, 2001 Polychrotidé. Anolis yoroensis, 2001 Polychrotidé. Anolis zeus, 2001 Polychrotidé.
Serpents Typhlops roxaneae, Wallach, 2001 Tropidophis morenoi Hedges, Garrido et Díaz, 2001 Serpent tropidophiidé. Coluber largeni Schätti, 2001 Colubridé Omoadiphas aurula Köhler, McCranie et Wilson, 2001 Colubridé découvert au Honduras (endémique). Coluber schmidtleri Schätti et McCarthy, 2001 Colubridé découvert en Iran. Sibon lamari, Solorzano, 2001 Colubridé découvert au Costa Rica Rev. Biol. Trop., 49 (3-4) : 1111-1120. Hydrophis sibauensis Rasmussen, Auliya et Böhme, 2001 Serpent de mer (Élapidés Hydrophiinés) découvert dans l'île de BornéoA new species of the sea-snake genus Hydrophis (Serpentes: Elapidae) from a river in the West Kalimantan (Indonesia, Borneo), Herpetologica 57 (1) : 23-32).. Bothrocophias myersi Gutberlet et Campbell, 2001 Vipéridé découvert en Colombie. Vipera orlovi Tuniyev et Ostrovskikh, 2001 Vipéridé découvert dans le CaucaseTuniyev, B.S. & S.V. Ostrovskikh, Two new species of vipers of kaznakovi complex (Ophidia, Viperinae) from the Western Caucasus, Russian Journal of Herpetology, 8 : 117-126. Vipera magnifica Tuniyev et Ostrovskikh, 2001 Vipéridé découvert dans le Caucase Trimeresurus vogeli David, Vidal et Pauwels, 2001 Vipéridé découvert en Thaïlande. Bothrops muriciensis Ferrarezzi, 2001 Vipéridé
Espèces fossiles (2001) Tortues Azabbaremys moragjonesi Gaffney, Moody et Walker, 2001 Pélomédusidé découvert dans le Paléocène du Mali. Dinosaures Masiakasaurus knopfleri Sampson et al., 2001 Dinosaure théropode noasauridé découvert à Madagascar. Le nom de genre est construit sur le malgache masiaka ("vicieux"). L'épithète spécifique est dédiée à Mark Knopfler, guitariste du groupe de rock britannique Dire Straits.
Neimongosaurus yangi Zhang et al., 2001
Paralititan stromeri J. Smith, Lamanna, Lacovara, Dodson, P. Smith, Poole, Giegengack et Attia, 2001 Dinosaure titanosauridé découvert dans le Crétacé supérieur d'Égypte. Sa longueur est estimée à 27 mètresScience, 292 : 1704-1706 ( juin 2001).
Chasmosaurus irvinensis Holmes, Forster, Ryan et Shepherd, 2001 Dinosaure cératopsien découvert dans les années 1950A new species of Chasmosaurus (Dinosauria : Ceratopsia) from the Dinosaur Park Formation of southern Alberta, Revue canadienne des sciences de la terre 38 (10) : 1423-1438 (2001)..
Bienosaurus lefengensis Dong, 2001 Dinosaure scélidosauridé découvert dans le Jurassique de Chine.
Quilmesaurus curriei Coria, 2001 Dinosaure théropode découvert en PatagonieA new theropod from the Late Cretaceous of Patagonia, in Tanke and Carpenter, Mesozoic Vertebrate life, Indiana University Press : 3-9 (2001)..
Eotyrannus lengi Hutt, Naish, Martill, Barker et Newbery, 2001 Découvert dans le Barrémien du Wessex (Angleterre) Cretaceous Research 22 : 227-242..
Aletopelta coombsi Kirkland et Ford, 2001 Ankylosauridé découvert en Californie.
Losillasaurus giganteus Casanovas, Santafe et Sanz, 2001 Turiasaure découvert en Espagne.
Serpents Corallus priscus Rage, 2001 Boidé découvert dans le Paléocène du Brésil. Hechtophis austrinus Rage, 2001 Boidé découvert dans le Paléocène du Brésil. Waincophis pressulus Rage, 2001 Boidé découvert dans le Paléocène du Brésil. Waincophis cameratus Rage, 2001 Boidé découvert dans le Paléocène du Brésil.
2002 Espèces vivantes décrites en 2002 Lézards Varanus juxtindicus Böhme, Philipp et Ziegler, 2002 Varanidé. Dibamus kondaoensis, 2002 Cnemaspis heteropholis Bauer, 2002 Gekkonidé découvert en Inde. Cyrtodactylus abrae, 2002 Cyrtodactylus phongnhakebangensis Ziegler, Rössler, Herrmann et Vu, 2002 Gecko découvert au Vietnam. Cyrtodactylus slowinskii Bauer, 2002 Gecko découvert au Myanmar. Cyrtodactylus brevidactylus Bauer, 2002 Gecko découvert au Myanmar. Cyrtodactylus sumonthai, 2002 Hemidactylus kamdemtohami Bauer et Pauwels, 2002 Gekkonidé découvert sur le mont Iboundji au Gabon. L'épithète spécifique honore le Dr. André Kamdem Toham, ichthyologue camerounaisAfrican Journal of Herpetology, 51 (1) : 1-8 (2002).. Mesalina bahaeldini Segoli, Cohen & Werner, 2002 Lacertidé découvert en Égypte, où il est endémique. Mesalina kuri Joger et Mayer, 2002 Lacertidé découvert au Yémen.
Serpents Eunectes beniensis Dirksen, 2002 Serpent boidé. Tropidophis hendersoni Hedges et Garrido, 2002 Serpent tropidophiidé. Pantherophis slowinskii (Burbrink, 2002) (= Elaphe slowinskii) Colubridé découvert en Louisiane. Le nom spécifique de cette nouvelle espèce de couleuvre a été dédicacé per Burbrink à Joseph ("Joe") Slowinski, hérpétologiste américain, spécialiste des élapidés, grand découvreur d'espèces nouvelles, décédé à l'âge de 38 ans des suites d'une morsure de serpent - un krait (Bungarus sp.) - survenue au Myanmar le , le jour même de l'attaque terroriste contre le World Trade Center de New York, sa ville natale. Micrurus pacaraimae, 2002 Élapidé. Trimeresurus gumprechti David, Vogel, Pauwels et Vidal, 2002 Vipéridé découvert en Thaïlande. Bothrops alcatraz Marques, Martins et Sazima, 2002 Vipéridé découvert dans l'île d'Alcatrazes (en face de Saõ Paulo) au BrésilA new insular species of pitviper from Brazil, with comments on evolutionary biology and conservation of the Bothrops jararaca group (Serpentes, Viperidae), Herpetologica 58 (3) : 303-312.. Atheris hirsuta Ernst et Rödel, 2002 Vipéridé découvert dans le parc national Taï, en Côte-d'Ivoire.
Accession au statut d'espèce (2002) Pantherophis emoryi (Baird et Girard, 1653) Sous-espèce d'Elaphe guttata élevée au rang d'espèce Burbrink, 2002 Crotalus abyssus Sous-espèce de Crotalus viridis élevée au rang d'espèce Douglas, Douglas, Schuett, Porras et Holycross, 2002. Crotalus cerberus Sous-espèce de Crotalus viridis élevée au rang d'espèce . Crotalus concolor Sous-espèce de Crotalus viridis élevée au rang d'espèce . Crotalus helleri Sous-espèce de Crotalus viridis élevée au rang d'espèce . Crotalus lutosus Sous-espèce de Crotalus viridis élevée au rang d'espèce . Crotalus oreganus Sous-espèce de Crotalus viridis élevée au rang d'espèce .
Espèces fossiles (2002) Crocodiliens Goniopholis baryglyphaeus Schwarz, 2002 Goniopholidé. Volia athollandersoni Molnar, Worthy et Willis, 2002 Mékosuchidé découvert dans les îles Fidji.
Dinosaures Anabisetia saldiviai Coria et Calvo, 2002 Dinosaure iguanodonte découvert dans le Crétacé de Patagonie. Bissektipelta archibaldi Averianov, 2002 Dinosaure ankylosauridé découvert dans le Crétacé de l'Afghanistan. Sinovenator changii Xu et al., 2002 Dinosaure troodontidé découvert dans le Crétacé de Chine.. Aucasaurus garridoi Coria, Chiappe et Dingus, 2002 Dinosaure abélisauridé découvert dans le Santonien d'Argentine.
Ptérosaures Hatzegopteryx thambema Buffetaut, Girgorescue & Csiki, 2002 Découvert dans le Crétacé de Roumanie. Thalassodromeus sethi Kellner & Campos, 2002 Découvert au Brésil.
Serpents Vipera natiensis Bailon, Garcia-Porta & Quintana-Cardona, 2002 Vipéridé découvert dans le Pliocène de l'île de Minorque (Baléares, Espagne) Comptes Rendus Palevol 1 (4) : 227-234 (septembre 2002)..
2003 Espèces vivantes décrites en 2003 Lézards Calotes chincollium Vindum, 2003 Agamidé découvert au Myanmar Elgaria usufa Smith, Lemos-Espinal, Chiszar et Ingrasci, 2003 Anguidé. Dibamus booliati Das et Yaakob, 2003 Dibamidé découvert en MalaysiaThe Raffles Bulletin of Zoology 51 (1) : 143-147.. Cyrtodactylus aaroni Cyrtodactylus gansi Bauer, 2003 Gecko découvert au Myanmar. Cyrtodactylus ayeyarwadyensis Bauer, 2003 Gecko découvert au Myanmar. Cyrtodactylus chanhomeae Cyrtodactylus wakeorum Bauer, 2003 Gecko découvert au Myanmar. Cyrtodactylus russelli Bauer, 2003 Gecko découvert au Myanmar. Cyrtodactylus annandalei Bauer, 2003 Gecko découvert au Myanmar. Cyrtodactylus chrysopylos Bauer, 2003 Gecko découvert au Myanmar. Cyrtodactylus aequalis Bauer, 2003 Gecko découvert au Myanmar. Cyrtodactylus tigroides Hemidactylus foudaii Baha el Din, 2003 Gekkonidé découvert en Égypte. Hemidactylus pseudomuriceus Henle et Böhme, 2003 Gecko Liolaemus flavipiceus Cei et Videla, 2003 Liolémidé découvert en Argentine Phymaturus verdugo Cei et Videla, 2003 Liolémidé découvert en Argentine
Serpents Morelia macburniei Hoser, 2003 Boidé. Morelia mippughae Hoser, 2003 Boidé. Eirenis coronelloides Sivan & Werner, 2003 Colubridé. Leptomicrurus renjifoi Lamar, 2003 Elapidé découvert en ColombieRevista de Biologia Tropical, septembre 2003.. Micrurus camilae, 2003