Les Bunyaviricetes sont une classe de virus à ARN monocaténaire négatif segmenté, possédant principalement un génome tripartite. Ces virus infectent les arthropodes, les plantes, les protozoaires et les vertébrés. Le nom Bunyaviricetes dérive de Bunyamwera, où le virus de Bunyamwera a été découvert pour la première fois.
Les bunyavirus appartiennent au cinquième groupe de la classification de Baltimore, qui regroupe les virus à génome ARN monocaténaire de polarité négative. Ils possèdent un virion sphérique enveloppé. Bien que généralement présents chez les arthropodes ou les rongeurs, certains virus de cette classe infectent occasionnellement l'humain. Certains infectent également les plantes. De plus, il existe un groupe de bunyavirus dont la réplication est restreinte aux arthropodesucia.
La majorité des bunyavirus sont transmis par des vecteurs. À l'exception des hantavirus et des arénavirus, tous les virus de la classe des Bunyaviricetes sont transmis par des arthropodes (moustiques, tiques ou phlébotomes). Les hantavirus se transmettent par contact avec les excréments de rongeurs. L'incidence de l'infection est étroitement liée à l'activité du vecteur ; par exemple, les virus transmis par les moustiques sont plus fréquents en été.
Les infections humaines par certains Bunyaviricetes, comme le virus de la fièvre hémorragique de Crimée-Congo, sont associées à des taux élevés de morbidité et de mortalité ; par conséquent, la manipulation de ces virus est effectuée dans des laboratoires de biosécurité de niveau 4. Ils sont également responsables du syndrome de fièvre sévère avec thrombocytopénie.
Les hantavirus constituent un autre membre important de la classe des Bunyaviricetes sur le plan médical. On les trouve dans le monde entier et ils sont relativement fréquents en Corée, en Scandinavie (y compris en Finlande), en Russie, dans l'ouest de l'Amérique du Nord et dans certaines régions d'Amérique du Sud. Les infections à hantavirus sont associées à une forte fièvre, un œdème pulmonaire et une insuffisance respiratoire. Le taux de mortalité varie considérablement selon la forme, pouvant atteindre 50 % pour les hantavirus du Nouveau Monde (Amériques), 15 % pour les hantavirus de l'Ancien Monde (Asie et Europe) et seulement 0,1 % pour le virus de Puumala (principalement en Scandinavie). La réaction des anticorps joue un rôle important dans la diminution des niveaux de virémie.
Virologie Structure
La morphologie des bunyavirus est assez similaire à celle de la famille des Paramyxoviridae ; les bunyavirus forment des virions sphériques enveloppés d’un diamètre de 80 . Ces virus ne contiennent pas de protéines de matrice. En revanche, les glycoprotéines de surface virales, qui forment une couche continue à la surface du virion, joueraient un rôle dans la formation de nouveaux virions par bourgeonnement à partir d’une membrane cellulaire.
Génome Les bunyavirus possèdent un génome bi- ou tripartite constitué d’un grand segment d’ARN (L) et d'un ou plusieurs petits segments, ou d’un grand (L), d’un moyen (M) et d’un petit (S). Ces segments d’ARN sont monocaténaires et s’organisent en hélice au sein du virion. De plus, ils présentent une structure pseudocirculaire due à la complémentarité de leurs extrémités. Le segment L code l'ARN-polymérase ARN-dépendante, essentielle à la réplication de l’ARN viral et à la synthèse de l'ARNm. Le segment M code pour les glycoprotéines virales, qui font saillie à la surface du virus et permettent à celui-ci de se fixer à la cellule hôte et d'y pénétrer. Le segment S code pour la protéine de la nucléocapside (N).
La plupart des bunyavirus possèdent des segments L et M de polarité négative. Le segment S du genre Phlebovirus, et les segments M et S du genre Orthotospovirus sont ambisens. Ambisens signifie que certains gènes du brin d'ARN sont de polarité négative et d'autres de polarité positive. Le segment S ambisens code la nucléoprotéine virale (N) en polarité négative et une protéine non structurale (NS) en polarité positive. Le segment M ambisens code la glycoprotéine (GP) en polarité négative et une protéine non structurale (NSm) en polarité positive.
La taille totale du génome varie de 10,5 à 22,7 kpb.
Cycle de vie
Le génome ambisens nécessite deux cycles de transcription. Dans un premier temps, l'ARN de polarité négative est transcrit en ARNm et en un intermédiaire réplicatif complet. À partir de cet intermédiaire, un ARNm sous-génomique codant la petite protéine non structurale est produit, tandis que la polymérase produite après le premier cycle de transcription peut alors répliquer l'ARN complet pour produire des génomes viraux.
Les bunyavirus se répliquent dans le cytoplasme, tandis que les protéines virales transitent par le réticulum endoplasmique et l'appareil de Golgi. Les virions matures bourgeonnent de l'appareil de Golgi dans des vésicules qui sont transportées à la surface cellulaire.
Transmission Les bunyavirus infectent les arthropodes, les plantes, les protozoaires et les vertébrés. Les plantes peuvent héberger des bunyavirus appartenant aux familles des Tospoviridae et des Fimoviridae (par exemple, la tomate, le pois d'Angole, le melon, le blé, le framboisier, le gainier et le rosier). Certains membres de ces familles sont spécifiques aux insectes, comme les , initialement isolés chez des cécidomyies fantômes et depuis identifiés chez divers insectes, notamment des papillons de nuit, des guêpes, des abeilles et des diptères.
Taxonomie
La classe des Bunyaviricetes comprend deux ordres qui regroupent 16 familles. Ces taxons sont listés ci-après (les suffixes -virales et -viridae désignant respectivement un ordre et une famille) :
Elliovirales Cruliviridae Fimoviridae Hantaviridae Peribunyaviridae Phasmaviridae Tospoviridae Tulasviridae Hareavirales Arenaviridae Discoviridae Konkoviridae Leishbuviridae Mypoviridae Nairoviridae Phenuiviridae Tosoviridae Wupedeviridae
Notes et références