Le (NCBI, littéralement ) est un institut national américain pour l'information biologique moléculaire.

Historique Cet organisme, fondé en 1988 et situé à Bethesda dans le Maryland, fait partie de la Bibliothèque américaine de médecine, un des Instituts américains de la santé.

Missions Le NCBI conduit des recherches dans la biologie informatique, développe des logiciels pour analyser des données de génome et fournir des informations biomédicales.

Le NCBI n'est pas une base de données, mais il développe aussi des bases de données publiques telles que : GenBank ; dbSNP ; RefSeq ; PubMed.

Il est en quelque sorte le pendant américain de l’Institut européen de bio-informatique (EBI).

Le NCBI propose et contient une base de données qui n'est qu'indicative. Le site internet du NCBI précise que cette base n'est pas une source fiable pour la nomenclature ou de classification, et qu'il faut consulter la littérature scientifique pertinente pour les informations les plus fiables (Voir bas de page sur cet exemple de recherche.). La taxonomie du NCBI représente environ 10 % des espèces vivantes de la planète. Cette taxonomie est une classification curée et se propose comme une nomenclature organisée pour les séquences d'organismes dans des bases de données publiques..

Le TaxID (identifiant unique dans la taxonomie du NCBI) sert de lien entre les trois bases de données du (INSDC, ). dont sont membres la DNA Data Bank of Japan (DDBJ), le NCBI (États-Unis) et l'Institut européen de bio-informatique (EMBL-EBI, Europe)..

Notes et références

Voir aussi Articles connexes Entrez, le système global de recherches inter-bases de données du NCBI. BLAST, un logiciel du NCBI, permettant la comparaison de séquences de nucléotides et de protéines. La liste des pages Wikipédia décrivant un taxon utilisant une référence au NCBI.

Liens externes

Site officiel Sa base de données taxonomique

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