La DsRed est une protéine tétramérique ayant la propriété d'émettre une fluorescence de couleur rouge. Issue d'un corail (Discosoma), cette protéine est intrinsèquement fluorescente. Son gène peut être fusionné in-vitro au gène d'une protéine que l'on souhaite étudier. Le gène recombinant est ensuite réintroduit dans des cellules ou un embryon, qui va alors synthétiser la protéine de fusion, alors fluorescente. On pourra alors l'observer à l'aide d'un microscope à fluorescence, par exemple. Cette méthode permet d'étudier les protéines dans leur environnement naturel : la cellule vivante.
La DsRed, un maximum d'excitation à (lumière verte). La longueur d'onde d'émission maximale est à . L'un de ses défauts rédhibitoires est la lenteur de maturation de la protéine car l'une des formes intermédiaires possède une fluorescence verte similaire à celle de la protéine fluorescente verte (GFP).
Il existe maintenant différents variants de la DsRed qui ont été obtenus en modifiant celle-ci par ingénierie génétique. Ces étapes de mutation ont permis d'obtenir des formes dimériques, monomériques, d'augmenter la brillance ou de changer la gamme de longueur d'onde concernées par les spectres d'excitation et d'émission.
Variants obtenus par mutagenèse : dimer2 : variant dimérique mRFP1 : variant monomérique, maturation lente
dTomato : variant dimérique tdTomato : variant tétramérique mOrange : variant monomérique, fluorescence orange mBanana : variant monomérique, fluorescence orange mHoneydew : variant monomérique, fluorescence verte-orange mStrawberry : variant monomérique, fluorescence rouge entre DsRed et mRFP. mCherry : variant monomérique, fluorescence similaire à mRFP avec une maturation plus rapide et une meilleure stabilité.
Bibliographie Shaner et al., « Improved monomeric red, orange and yellow fluorescent proteins derived from Discosoma sp. red fluorescent protein », Nature Biotechnology, vol. 22, pp. 1567 à 1572, 2004.
Notes et références
Catégorie:Imagerie cellulaire Catégorie:Protéine Catégorie:Marqueur fluorescent