La taxinomie des Chromista est en pleine évolution voire révolution, et les différentes classifications sont très disparates, notamment entre les classifications qui maintiennent une taxonomie plus classique et les classifications purement cladistiques qui ont réparti le groupe dans les clades SAR, , Haptista, .
Les ChromistesDans leur ouvrage Classification phylogénétique du vivant, Guillaume Lecointre et Hervé Le Guyader désignent les Chromistes sous le nom de « lignée brune ». () sont un règne d'organismes uni- et pluricellulaires eucaryotes regroupant des taxons historiquement considérés comme des protozoaires (Foraminifères, Radiolaires, Ciliés), comme des champignons (Oomycètes, Labyrinthulomycètes) et des algues (Algues brunes, Diatomées, Dinoflagellés, Coccolithophores).
Historique Ce règne a été proposé par le biologiste britannique Thomas Cavalier-Smith en 1981 Cavalier-Smith, T. (1981). Eukaryote kingdoms: seven or nine?. Biosystems 14: 461-481. Les Chromista étaient d'abord un clade supposé d'organismes eucaryotes pour la plupart photosynthétiques, regroupant également certains organismes autrefois classés parmi les « champignons inférieurs » — donc hétérotrophes. La pertinence de ce clade a été remise en cause par des études de 2007Burki , 2007, Phylogenomics Reshuffles the Eukaryotic Supergroups. rapprochant les Stramenopiles des Rhizaria. Il a donc été proposé d'utiliser le terme de Chromista pour désigner l'ensemble présumé monophylétique formé par les Harosa et les Hacrobia à la place du terme de Chromalveolata au sens large.
Les Chromistes sont moins diversifiés que les algues vertes mais plus que les algues rougesAugier M (1965). Biochimie et taxinomie chez les Algues. Bulletin de la Société Botanique de France, 112(sup1), 8-15..
Le groupe Chromista est polyphylétique, alors, ce nom n'est plus utilisé pour le groupe.
Étymologie Le terme Chromista dérive du grec , couleur, en référence aux pigments de ces organismes qui leur donne une teinte plus ou moins soutenue. Le terme fut inventé en 1981 par le biologiste britannique Thomas Cavalier-Smith, sur la base de termes plus anciens, par exemple Chromophyta.
Caractéristiques propres On trouve des caractéristiques propres au groupe, qui peuvent avoir disparu secondairement : Un réticulum périplastidial, situé entre les deux enveloppes du chloroplaste et les deux membranes externes. Les deux sous-groupes Straménopiles et Haptophytes présentent les mêmes pigments photosynthétiques. Le chloroplaste de la cellule est constitué de quatre membranes : les deux membranes communément trouvées chez les chloroplastes et deux membranes externes reliées le plus souvent à l'enveloppe nucléaire. Cette situation serait le résultat d'une endosymbiose secondaire et plus précisément d'une ingestion d'une Rhodophyte unicellulaire par un autre Eucaryote. À ce sujet, la communauté scientifique cherche à savoir si l'endosymbiose s'est effectuée plusieurs fois au sein des Chromistes ou si cela a été réalisé une seule fois — et l'endosymbiote ensuite perdu —, ce qui résoudrait le problème des Straménopiles non photosynthétiques.
Géologie Le plus ancien fossile connu présumé date du Précambrien ().
En effet, le Précambrien récent a livré des fossiles de type « film carboné », se présentant principalement sous la forme de simples empreintes noirâtres dans la roche. Si certaines de ces compressions sont dépourvues de caractéristiques distinctes et correspondraient à d'anciens tapis microbiens, d'autres exhibent une structure dotée d'un thalle. Cette morphologie suggère qu'elles appartiennent à des organismes analogues à des algues, peut-être des algues brunes, ou phéophytes. Bien que les phéophytes puissent avoir des origines remontant à l'Ordovicien, leurs traces fossiles demeurent rares avant le Miocène.
Les chromistes dotés d'un squelette minéral, de silice ou de carbonate de calcium, possèdent un registre fossile bien plus fourni. L'accumulation de leurs tests fossilisés, comme ceux des diatomées, des coccolithophores et des silicoflagellés, est parfois à l'origine de formations rocheuses entières. Leur origine est ancienne, avec des fossiles potentiels mais contestés dès le Précambrien récent. Les premiers diatomées et coccolithophores incontestables apparaissent au Jurassique, tandis que les chrysophytes et les silicoflagellés sont avérés à partir du Crétacé. Pour la majorité des autres chromistes, les témoignages fossiles, extrêmement fragmentaires, ne remontent pas au-delà de cette même période. Au Cénozoïque, les restes de chromistes siliceux, notamment les diatomées et les chrysophytes, deviennent souvent prépondérants dans les sédiments lacustres.
Liste des embranchements/divisions Selon AlgaeBase (29 janvier 2022) : Embranchement des Bacillariophyta Karsten Embranchement des Bigyra Cavalier-Smith Embranchement des Cryptophyta Cavalier-Smith Embranchement des Katablepharidophyta N.Okamoto & I.Inouye Embranchement des Ochrophyta Cavalier-Smith Embranchement des Telonemia Shalchian-Tabrizi & al. Embranchement des Chromista phylum incertae sedis sous-règne des Hacrobia Embranchement des Cryptista Cavalier-Smith Embranchement des Haptophyta Hibberd ex Edvardsen & Eikrem sous-règne des Harosa (supergroupe SAR) infra-règne des Halvaria (ou Heterokonta ?) Embranchement des Ciliophora Doflein Embranchement des Miozoa Cavalier-Smith Embranchement des Oomycota Arx infra-règne des Rhizaria Embranchement des Foraminiferida d'Orbigny
Selon Cavalier-Smith (1981, 2004, 2010)Thomas Cavalier-Smith, "Eukaryotic kingdoms: seven or nine?", BioSystems, Vol.14, No.3-4, 1981, p.461–481. Thomas Cavalier-Smith, "Only six kingdoms of life", Proceedings of the Royal Society B, Vol.271, No.1545, June 22, 2004, p.1251–1262. : sous-règne des Harosa (Cavalier-Smith 2010) infrarègne des Heterokonta (Cavalier-Smith 1986) embranchement des Bigyra (Cavalier-Smith 1998) embranchement des Pseudofungi (Cavalier-Smith 1986) embranchement des Ochrophyta (Cavalier-Smith 1986) sous-embranchement des Phaeista (Cavalier-Smith 1995) infraembranchement des Hypogyrista (Cavalier-Smith 1995) infraembranchement des (Cavalier-Smith 1986) sous-embranchement des Diatomeae (Dumortier 1821) infrarègne des Alveolata (Cavalier-Smith 1991) embranchement des Myzozoa (Cavalier-Smith 2004) sous-embranchement des Dinozoa (Cavalier-Smith 1981) sous-embranchement des Apicomplexa (Levine 1970) embranchement des Ciliophora (Doflein 1901) infrarègne des Rhizaria (Cavalier-Smith 2002) embranchement des Cercozoa (Cavalier-Smith 1998) embranchement des Retaria (Cavalier-Smith 1999) sous-embranchement des Foraminifera (Eichwald 1830) sous-embranchement des Radiozoa (Cavalier-Smith 1987) sous-règne des Hacrobia (Okamoto 2009) embranchement des Cryptista (Cavalier-Smith 1989) embranchement des Haptophyta (Hibberd 1976) embranchement des Heliozoa (Haeckel 1862)
Selon : division des Bacillariophyta
Selon : embranchement des Cryptophyta embranchement des Haptophyta embranchement des Hyphochytriomycota embranchement des Labyrinthista embranchement des Ochrophyta embranchement des Oomycota embranchement des embranchement des Chromista phylum incertae sedis
Selon : sous-règne Hacrobia embranchement des Cryptophyta embranchement des Haptophyta embranchement des Heliozoa sous-règne des Harosa infra-règne des Alveolata embranchement des Ciliophora embranchement des Myzozoa infra-règne des Heterokonta embranchement des Bigyra embranchement des Ochrophyta embranchement des Oomycota infra-règne des Rhizaria embranchement des Cercozoa embranchement des Foraminifera embranchement des Radiozoa
Selon Aubert (2017). : imperium Eukaryota regnum Chromista subregnum Hacrobia phylum Haptista phylum Cryptista subregnum Harosa infraregnum Rhizaria phylum Cercozoa phylum Retaria infraregnum Halvaria superphylum Alveolata phylum Myzozoa phylum Ciliophora superphylum Heterokonta phylum Bigyra phylum Pseudofungi phylum Ochrophyta
Voir aussi Articles connexes Chromophyte Chromalveolata (classification phylogénétique) Stramenopiles (classification phylogénétique) Classification phylogénétique du vivant, un ouvrage de Guillaume Lecointre et Hervé Le Guyader Mildiou
Liens externes
Chromista (Univ Paris Sud 11)
Notes et références Notes
Références
Catégorie:Biconte (nom scientifique) Catégorie:Taxon décrit en 1981