vignette|Taille et diversité des organismes du sol. La microfaune, désigne l'ensemble des tout petits animaux (inférieurs à ) présents dans un espace donné. La plus grande partie de la microfaune n'est visible qu'à la loupe, à la loupe binoculaire ou au microscope. En dépit de sa discrétion, elle joue un rôle primordial pour la formation et l'évolution des sols et des sédiments, ainsi que pour la décomposition du bois mort et des cadavres animaux. Elle joue ainsi un rôle majeur dans la minéralisation de la matière organique, le cycle du carbone et de nombreux grands cycles biogéochimiquesMaldague M (1959) Importance et rôles de la microfaune du sol. Bull. Agric. Congo Beige, 50, 5-34..
Des liens complexes d'interdépendance existent entre la microfloreMaldague, M. (1958). Relations entre microfaune et microflore du sol dans la région de Yangambi (Congo belge). Agricultura (Louvain), 2, 340-351., la microfonge et la microfaune et les populations microbiennes. Une grande partie de la microfaune joue un rôle important de décomposeur.
La microfaune est notamment vulnérable à la destruction de son milieu (par le labour ou la déforestationBetsch, J. M., Kilbertus, G., Proth, J., Betsch-Pinot, M. C., Couteaux, M. M., Vannier, G., & Verdier, B. (1980). Effets à court terme de la déforestation à grande échelle de la forêt dense humide de Guyane française sur la microfaune et la microflore du sol. Proc. VII Intern. Coll. Soil. Zool., EPA, 560(13.80), 038. par exemple) et à l'exposition à la lumière et aux UV solaires. La granulométrie du substrat et du sédiment influent sur la microfaune et inversementBlanc-Vernet, L. (1958). Les Milieux sédimentaires littoraux de la Provence occidentale (côte rocheuse), relations entre la microfaune et la granulométrie du sédiment, par Laure Blanc-Vernet. Impr. nationale..
Pour sa valeur bioindicatrice, elle a été très étudiée, notamment dans les années 1930 à 1960 par milieu, par grande zone tempérée et tropicaleDelamare-Deboutteville, C. (1950). Recherches écologiques sur la microfaune du sol des pays tempérés et tropicaux (Doctoral dissertation). ou encore à l'échelle d'un paysRemy, P. A., & Condé, B. (1961). Sur la Microfaune du sol de Grande-Bretagne. Journal of Natural History, 4(39), 149-154..
La microfaune tient une place importante dans le réseau trophique ; elle est notamment une importante source de nourriture pour les poissons et les oiseauxEastham, A. (1999).Les oiseaux et la microfaune. Gallia préhistoire, 41(1), 113-127.
Catégories de microfaunes Ce terme est souvent associé à la litière végétale de feuilles, racines, écorcesTouchot, F. (1984). Relations microfaune-microflore dans le cadre de la biodégradation des écorces et des litières (Doctoral dissertation). et petits bois-mort, forestière notammentArpin, P., Kilbertus, G., Ponge, J. F., & Vannier, G. (1980). Importance de la microflore et de la microfaune en milieu forestier. Actualités d'écologie forestière: sol, flore, faune, 87-150., et donc à la flore sus-jacente)Maldague M.E (1961) Relations entre le couvert végétal et la microfaune : leur importance dans la conservation biologique des sols tropicaux. Publications de l'Institut National pour l'Étude Agronomique du Congo.(IN É. AC). ainsi qu'au sol sous-jacent (microfaune édaphiqueMignolet-Kevers, A., & Berthet, P. (1977). Étude de la micro-faune édaphique à Mirwart. Productivité biologique en Belgique. Éditions Duculot, Paris, Gembloux, 245-261.), mais les naturalistes catégorisent également la microfaune par époque géologique (ex. : Marie, Pierre (1936). Sur la microfaune crétacée du Sud-Est du Bassin de Paris. CR Acad. Sci, 203, 97-99., par type de faune (exemple microfaune annélidienneBellan, G. (1962). Note préliminaire sur la microfaune annélidienne de quelques peuplements marins de la baie de Marseille. Recl Trav. Stn mar. Endoume, 25(39), 5-22.) ou selon sa profondeur (ex. : « microfaune endogée »Rémy, P. (1956). Sur la microfaune endogée des jardins de Tanger (Symphyles, Pauropodes, Pénicillates, Protoures, Palpigrades). Bulletin de la Société des Sciences Naturelles de Maroc, 35, 103-108.REMY, P. A., & DE L'ANGOLA, I. P. I. (1956). à l'étude de la microfaune endogée de l'Afrique tropicale: Palpigrades et Pauropodes. Revue Zool. Bot. afr, 53, 327-335.). Ils parlent aussi et par exemple de : Swedmark, B., & Teissier, G. (1959). Halammohydra et Otohydra, Hydrozoaires de la microfaune des sables et l’ordre des Actinulides. In Proceedings of the XVth International Congress of Zoology, London 1958 (Vol. 4, No. 15, pages 330 à 332).Swedmark, B. (1956). Étude de la microfaune des sables marins de la région de Marseille. Arch. Zool. exp. gén, 93, 70-95Fize, A. (1964). Contribution à l'étude de la microfaune des sables littoraux du golfe d'Aigues-Mortes. Université, Faculté des Sciences. ; « microfaune benthique » (ex. : en bordure de plateau continental La Microfaune benthique du plateau continental congolais: inventaire, répartition, stratigraphie du quaternaire supérieur G Kouyoumontzakis - 1979) ; « microfaune pélagique », catégorie fonctionnellement et écologiquement en partie reliée à la précédenteCarozzi, A. (1949). Rapports entre microfaune benthique et microfaune pélagique. Arch. Se, Genève, 2(1). ; « microfaune des argiles »Marie, P. (1941). Sur la microfaune des argiles albiennes du Pays de Bray. Cr somm. Séanc. Soc. géol. Fr, 12, 82-84. ; « microfaune des sédiments » (ex. : foraminifères)Blanc-Vernet, L. (1967). Contribution a l’étude des foraminifères de Méditerranée: relations entre la microfaune et le sédiment, biocénoses actuelles, thanatocénoses pliocènes et quaternaires ; Thèse de doctorat. Station Marine d'Endoume. ; « microfaune des laisses d'étangs »Travé, M. J. (1958). Quelques remarques sur la microfaune des laisses d'étangs. 83. Congr. Soc. Savant, 611-618. ; « microfaune des « eaux libres »Lam Hoai, T., Amanieu, M., & Lasserre, G. (1984). Microfaune des eaux libres de la Sarrasine, écosystème lagunaire semi-contrôlé méditerranéen. Vie et milieu, 34(4), 209-219. ; « microfaune des récifs », éventuellement fossilesGuernet, C., Poignant, A., & Saint-Martin, J. P. (1984). Contribution à l'étude de la microfaune des récifs messiniens d'Oranie Occidentale (Algérie). Geobios, 17(2), 155-165 ou de lagonsRenaud-Debyser, J. (1965) Note préliminaire sur la microfaune des fonds meubles du lagon (Baie de Saint Vincent), Nouvelle Calédonie. Cah. Pac, 7, 107-116. ; « microfaune des boues activées »Drakides, C. (1980). La microfaune des boues activées. Étude d'une méthode d'observation et application au suivi d'un pilote en phase de démarrage. Water Research, 14(9), 1199-1207. ; « paléomicrofaune », dans le cas des études de fossilesBouchud, J. (1959). Essai sur le renne et la climatologie du Paléolithique moyen et supérieur: La microfaune du Paléolithique moyen et supérieur (Doctoral dissertation). ; « microfaune du tube digestif » (le mot « microfaune » est parfois employé pour désigner une partie des organismes du rumen ou du tube digestif, les ciliés, par exempleBonhomme-Florentin, A., Blancou, J., & Latteur, B. (1978). des variations saisonnières de la microfaune du rumen de zébus. Protistologica, 14, 283-289.Blancou, J., Bonhomme, A., Barrat, J., & Pons, N. (1984). Microfaune du rumen des herbivores sauvages. Étude préliminaire sur le chevreuil et le chamois. Rev. Med. Vet, 135, 141-148.)...
Utilisations Parce que très spécifique à une époque géologique et/ou à un biotope particulier, et peu mobile, une partie de la microfaune a une valeur bioindicatrice de l'état, de l'évolution ou de la qualité de l'environnement, du solBetsch, J. M. (1972). La microfaune du sol à Madagascar, témoin de la santé des sols; Documentation IRD et du climat, de la circulation thermohalineManthé, S. (2006). Variabilité de la circulation thermohaline glaciaire et interglaciaire, en Atlantique Nord, tracée par les foraminifères planctoniques et la microfaune benthique (Doctoral dissertation)., ainsi que des évolutions du trait de côte ou des écotones estuariensHoibian, T. (1984). La microfaune benthique traceur de l'évolution d'un système deltaïque sous climat équatorial: le delta de la Mahakam (Kalimantan) (Doctoral dissertation)..
La microfaune fossile est utilisée pour préciser la stratigraphie et décrire les stratotypes de couches géologiques sédimentaires qui se sont formées aux époques où la microfaune existait (Carbonifère, par exemple) Lys, M. (1964) La microfaune dans ses applications à la stratigraphie du Carbonifère. CR, 5, 189-202.
Méthodes d'étude Une partie de cette faune n'est pas observable à l’œil nu ou n'est pas directement accessible à l'observation (ex. microfaune des grands fonds). Des méthodes spécifiques d'échantillonnageRenaud-Mornant, J. (1966). Problèmes d’échantillonnage de la microfaune des sédiments meubles marins. Méthodes et résultats. La Terre et la Vie, 2, 177-201. et d'évaluation qualitative et quantitativeBougis, P. (1950). Méthode pour l’étude quantitative de la microfaune des fonds marins (Meiobenthos). Vie Milieu, 1, 23-38. ou génétiques (ex. : métabarcoding récemment) ont peu à peu été mises au point par les naturalistes et scientifiques. Dans le sédiment fin c'est par exemple le carottage qui est le plus utiliséBlanc-Vernet, L. (1966). Note préliminaire sur la microfaune de quelques carottes de Méditerranée occidentale. Rec. Trav. Sta. Marine Endoume, 39(55), 305-308.
Pédofaune La microfaune du sol, ou pédofaune microscopique, désigne l'ensemble des tout petits animaux présents dans la litière et dans les couches superficielles de l'humus. Ces animaux mesurent en moyenne moins de .
Microfaune fossile L'étude des thanatocénoses via les fossiles qui en restent, inclut celle des microfaunes fossiles, contribue à la connaissance des paléopaysages ou d'oscillations climatiquesDarmedru, C. (1982). La microfaune dans les alternances marne-calcaire pélagiques du Crétacé inférieur vocontien (Sud-Est de la France) Mise en évidence d'oscillations climatiques (Doctoral dissertation, Université Claude Bernard-Lyon I) (résumé).. Les tourbières, les roches sédimentaires et le sol des grottesChaline, J. (1970). Pliomys lenki, forme relique dans la Microfaune du Würm ancien de la Grotte de Lezetxiki (Guipúzcoa-Espagne). Munibe, 22(1/2), 43-49.JEANNET, M. (2001). La microfaune et l'environnement de la grotte du Noisetier à Fréchet (Hautes-Pyrénées). Bulletin de la Société préhistorique de l'Ariège, 56, 83-89 (résumé. sont notamment utilisés pour cela.
La microfaune fossile est très utilisée (quand elle est disponible) pour préciser la stratigraphie de couches explorées par les archéologues ou paléontologuesDonze, P., Porthault, B., & Thomel, G. (1970). Le sénonien inférieur de Puget-Theniers (Alpes-Maritimes) et sa microfaune. Geobios, 3(2), 41-IN13. Chaline, J. (1971). La microfaune du Vallonnet (AM) et le problème des corrélations micro-macromammifères à la limite Pléistocène inférieur-moyen. Bulletin du musée d’Anthropologie préhistorique de Monaco, 17, 65-69..
Notes et références
Voir aussi Articles connexes
Vidéographie Balade au cœur de la litière forestière, film (macrophotographie), déposé sur Vimeo par « Avec ou sans ailes »
Bibliographie Delamare-Deboutteville, C. (1951). Microfaune du sol des pays tempérés et tropicaux. Hermann & C. Editeurs. Franz, H. (1950). État de nos connaissances sur la microfaune du sol. Ecologic (Colloques int. cent. natn. Rech. scient.), Paris, 1950, 81-92. Kilbertus, G., Vannier, G., & Verdier, B. (1976). Étude in situ de la recolonisation par la microfaune et la microflore des échantillons de sol forestier ayant subi un traitement thermique. Bulletin du Muséum National d'Histoire Naturelle. Renaud-Debyser, J., & Salvat, B. (1963) Éléments de prospérité des biotopes des sédiments meubles intertidaux et écologie de leurs populations en microfaune et macrofaune''. Vie Milieu, 14(3), 463-550.