M99 ou M-99 peut faire référence à :
Armes et domaine militaire Barrett M99, fusil de précision américain ; 7 cm Gebirgsgeschütz M99, canon de montagne austro-hongrois.
Sciences et techniques Astronomie M99 ou Messier 99 (ou NGC 4254), galaxie spirale de grand style dans la constellation de la Chevelure de Bérénice selon le catalogue de Messier.
Chimie M99 ou étorphine, un opioïde semi-synthétique.
Médecine Lésions biomécaniques, non classées ailleurs, d'après la classification internationale des maladies.
Transports Route M-99, une route dans le Michigan (États-Unis).
Voir aussi Sigles d'une lettre suivie de deux chiffres