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La seconda stagione della serie animata Young Justice, sottotitolata Invasion, è stata trasmessa in prima visione negli Stati Uniti dal 28 aprile 2012 dal canale Cartoon Network, fino al 16 marzo 2013.

La seconda stagione è stata rilasciata come due diversi cofanetti da due dischi contenenti 10 episodi ciascuno: la prima parte della seconda stagione è chiamata Young Justice: Invasion Destiny Calling, ed è stata rilasciata il 22 gennaio 2013 mentre la seconda parte è intitolata Young Justice: Invasion Game of Illusions ed è stata messa in vendita il 16 luglio 2013. La seconda stagione, Invasion, è uscita sempre il 18 novembre 2014.

n. Titolo originale Titolo italiano Prima TV USA 1 Happy New Year Felice anno nuovo 28 aprile 2012 2 Earthlings Amori intergalattici 5 maggio 2012 3 Alienated L'esplosione 12 maggio 2012 4 Salvage Missione salvataggio 19 maggio 2012 5 Beneath Missione alfa 26 maggio 2012 6 Bloodlines Viaggio nel tempo 2 giugno 2012 7 Depths Abissi 9 giugno 2012 8 Satisfaction Una nuova identità 29 settembre 2012 9 Darkest Il dubbio 6 ottobre 2012 10 Before the Dawn Esperimenti genetici 5 gennaio 2013 11 Cornered L'ascesa dei cavalieri 12 gennaio 2013 12 True Colors Gli scarabei 19 gennaio 2013 13 The Fix Il rapimento di Miss Martian 26 gennaio 2013 14 Runaways I fuggitivi 2 febbraio 2013 15 War Strana alleanza 9 febbraio 2013 16 Complications Padri e figli 16 febbraio 2013 17 The Hunt Il disegno di Luthor 23 febbraio 2013 18 Intervention Il potere della magia 2 marzo 2013 19 Summit Ologramma 9 marzo 2013 20 Endgame La rivincita degli eroi 16 marzo 2013

Felice anno nuovo Titolo originale: Happy New Year Diretto da: Tim Divar Scritto da: Greg Weisman

Trama Cinque anni dopo la squadra ha guadagnato nuovi membri (Blue Beetle, Beast Boy, Bumblebee, Lagoon Boy, Wonder Girl, Batgirl e Mal Duncan) con Tim Drake come nuovo Robin, l'ex Robin è diventato Nightwing, mentre Rocket e Zatanna sono state ammesse nella Justice League. Dopo che il cacciatore di taglie intergalattico Lobo attacca la sede delle Nazioni Unite, rivelando che il segretario generale Tseng è un alieno sotto mentite spoglie, alla Torre di Guardia, Adam Strange segnala che gli alieni hanno rubato la tecnologia Zeta del pianeta Rann e la stanno usando per invadere la Terra. SuperBoy, Miss Martian e Beast Boy vengono inviati su Rann, mentre Robin, Blue Beatle e Lagoon Boy devono scovare gli alieni sulla Terra e liberare gli ostaggi umani.

Amori intergalattici Titolo originale: Earthlings Diretto da: Doug Murphy Scritto da: Nicole Dubuc

Trama Superboy, Miss Martian e Beast Boy arrivano su Rann con Adam Strange per fermare l'invasione dei gremlins alla fonte. Essi vengono assistiti da Alanna e Sardath (Viene rivelato che Beast Boy è Garfield Logan e che sua madre è stata uccisa da Queen Bee). Dopo la battaglia, Miss Martian scopre la verità su ciò che i sei membri della Justice League hanno fatto cinque anni fa durante le 16 ore in cui erano controllati mentalmente dai chip di Vandal Savage.

Ascolti USA: telespettatori 1 853 000

L'esplosione Titolo originale: Alienated Diretto da: Mel Zwyer Scritto da: Kevin Hopps

Trama Miss Martian condivide quello che ha scoperto sui sei membri della Justice League durante le 16 ore mancanti, hanno attaccato una galassia facendo conoscere a diverse razze aliene la loro esistenza. Più tardi, sonda nella mente di un alieno Kroloteano catturato e scopre l'ubicazione della loro base sulla Terra. I membri della Justice League e della Squadra vengono scoperti e ne consegue una lotta, durante la quale il nemico si rivela essere Aqualad, che ha tradito i suoi compagni incolpandoli per la morte della sua amata Thula, e in seguito alla scoperta che Black Manta è il suo vero padre. Durante la fuga Aqualad fa detonatore una bomba che distrugge l'isola con i Kroloteani rimasti al suo interno, nonostante Superman abbia cercato di convincerli a salvarsi.

Ascolti USA: telespettatori 1 761 000

Missione salvataggio Titolo originale: Salvage Diretto da: Tim Divar Scritto da: Greg Weisman

Trama Wally West (che ha smesso i panni del supereroe insieme alla sua fidanzata Artemis), Jim Harper, Nightwing, Freccia Verde e Black Canary ritrovano Freccia Rossa, caduto in depressione nel corso della sua ricerca non riuscita per ritrovare l'originale Roy Harper, ma Freccia Rossa non intende farsi aiutare fino a quando non avrà portato a termine la sua missione; quando sembra arrivato al limite nel suo appartamento si presenta Cheshire (che ha sposato) con la loro figlia neonata informandolo che ha trovato un indizio su dove possa trovarsi il vero Speedy. Intanto Superboy, Wolf e Blue Beetle, seguono le tracce del leader dell'Intergang, Bruno Mannheim, che sta rianimando dei golem alieni grazie alla tecnologia di Apokolips. Il golem formato da quattro parti di metallo, roccia, legno e cristallo si dimostra immune a ogni attacco ma grazie ai poteri dello scarabeo Blue Beetle riesce a comprendere il suo linguaggio ma prima che possano aiutarlo due misteriose figure lo distruggono.

Ascolti USA: telespettatori 2 037 000

Missione alfa Titolo originale: Beneath Diretto da: Doug Murphy Scritto da: Brandon Vietti

Trama Blue Beetle sta cercando il suo amico Tye, recentemente scappato di casa, ma il ragazzo viene rapito prima che Jaime possa contattarlo. Una visita a casa di Tye conduce Jaime a credere che il fidanzato di sua madre sia responsabile della scomparsa invece la sua ipotesi si rivela un buco nell'acqua. Nel frattempo, Batgirl, Wonder Girl, Miss Martian e Bumblebee sono in rotta verso Bialya. Le ragazze scoprono un magazzino sotterraneo dove in diverse capsule sono rinchiusi dei giovani fuggiaschi, che vengono trasportati su un aereo, custodito da Psi-Mon, Ice Jr, Mammut, Shimmer e Devastation. Alla fine le ragazze riescono a sconfiggere Psi-Mon, Ice Jr, Mammut, Shimmer e Devastation ma i ragazzi salvati sono solo una parte del carico che Queen Bee deve consegnare al loro misterioso alleato e tra di loro c'è anche Tye.

Viaggio nel tempo Titolo originale: Bloodlines Diretto da: Mel Zwyer Scritto da: Peter David

Trama Alla base della squadra appare un ragazzino iperattivo che sostiene di essere un viaggiatore del tempo e nipote dell'attuale Flash (Barry Allen) che si presenta a casa di suo nonno a cui rivela più aneddoti di quanti dovrebbe (come il fatto che i figli che stanno aspettando sono dei gemelli). Impulso (Bart Allen) aiuta poi Flash e Kid Flash a salvare Central City dall'attacco di Neutron, che nel futuro da quale Impulse viene mostra come non abbia più i poteri, purtroppo sembra che il resto del futuro non sia cambiato, ciò vuol dire che il cambiamento non era stato scatenato da Neutron. Nel frattempo, Freccia Rossa e Cheshire si recano nella base della Lega delle Ombre, in Tibet, dove ritrovano e liberano finalmente l'originale Roy Harper.

Ascolti USA: telespettatori 1 944 000

Abissi Titolo originale: Depths Diretto da: Tim Divar Scritto da: Kevin Hopps

Trama Su richiesta di Nightwing, Artemis partecipa ad una missione della squadra per garantire il lancio di un satellite destinato a rafforzare le relazioni fra la Terra e Marte, ma Black Manta ha inviato Aqualad e i suoi uomini per distruggerlo. Durante la battaglia Lagoon Boy, a causa del suo astio nei controfronti di Superboy, attacca i nemici senza strategia e viene catturato, mentre Nightwing e Artemis affrontano l'assalto di terra. I due si trovano davanti il loro ex amico Aqualad, che non riesce a distruggere il razzo, ma uccide Artemis con la sua spada dell'acqua. Alla fine il razzo esplode lo stesso a causa di una bomba precedentemente piazzata al suo interno da Black Manta, e i giovani eroi non sono in grado di salvare la loro amica caduta. più tardi viene mostrato che in realtà la morte di Artemis era solo una messa in scena (di cui solo Wally, Nightwing, Aqualad e la stessa Artemis sono a conoscenza) e che dopo aver dato ad Artemis un gioiello magico che nasconde la sua vera identità quest'ultima parte con Aqualad.

Ascolti USA: telespettatori 1 890 000

Una nuova identità Titolo originale: Satisfaction Diretto da: Doug Murphy Scritto da: Greg Weisman

Trama Roy Harper dopo il suo risveglio si sente pieno di rabbia e risentimento, in parte con Freccia Verde per non aver capito che lo Speedy che è cresciuto con lui per otto anni era un clone, cerca vendetta contro Lex Luthor, che ha rovinato la sua vita il giorno in cui è stato rapito durante un appostamento alla LexCorp. Inizialmente Roy cerca di uccidere subito Luthor con un bazooka per poi affrontare la sua guardia del corpo nel parcheggio. Dopo uno scontro Lex propone un patto: in cambio della sua vita, Luthor dà a Roy un braccio cibernetico per sostituire quello che ha perso. Freccia Verde e Freccia Rossa arrivano troppo tardi per scongiurare la battaglia, e vengono informati da un soddisfatto Roy che da oggi ha deciso di farsi chiamare Arsenal.

Ascolti USA: telespettatori 1 796 000

Il dubbio Titolo originale: Darkest Diretto da: Mel Zwyer Scritto da: Jon Weisman

Trama Aqualad, Tigress (Artemis travestita), Ice Jr. e i Gemelli Terror vengono inviati da Black Manta a catturare Blue Beetle, ma sono ostacolati dall'interferenza di Impulso. Tuttavia, un dispositivo di tracciamento rubato da Aqualad durante il combattimento, disattiva tutta la sicurezza del Monte Giustizia. Catturati Beast Boy, Blue Beetle e Impulso, Aqualad ordina a Tigress di far detonare una bomba (che assomiglia a quella che è scoppiata sull'isola di Malina). Per fortuna Nightwing, Wolf e Superboy insieme a Sfera riescono a salvarsi mentre i ragazzi catturati vengono condotti in una base aliena assieme a tutti i ragazzi scomparsi.

Ascolti USA: telespettatori 1 982 000

Esperimenti genetici Titolo originale: Before the Dawn Diretto da: Tim Divar Scritto da: Kevin Hopps

Trama Nightwing conduce la squadra in missione per salvare i suoi membri catturati dal nuovo partner della Luce: una razza aliena conosciuta come i Cavalieri. Aqualad viene a sapere che gli adolescenti sono stati rapiti al fine di testare la capacità di un essere umano a sviluppare super poteri. Mentre è prigioniero, Blue Beetle origlia le intenzioni dei suoi carcerieri, intenti a rimuovere il suo scarabeo anche costo della sua vita. Impulso lo libera, e Blue si trova faccia a faccia con un agente chiamato Black Beetle. Nel frattempo Miss Martian incontra Aqualad per la prima volta dalla morte di Artemis e telepaticamente lo attacca, scoprendo la verità sul loro stato di agenti doppi che lascia Aqualad in uno stato di coma psichico e la stessa Miss Martian sotto shock. Alla fine dopo una battaglia i ragazzi vengono salvati e portati in salvo.

Ascolti USA: telespettatori 1 773 000

L'ascesa dei cavalieri Titolo originale: Cornered Diretto da: Doug Murphy Scritto da: Nicole Dubuc

Trama Despero, su consiglio del suo servitore robot L-Ron, mette gli occhi sui campioni della Terra. Attacca quindi il Palazzo di Giustizia, mentre i membri della squadra che vivevano nella grotta stavano requisendo i loro affetti personali. Dopo un duro scontro i ragazzi riescono a sconfiggere L-Ron ma a caro prezzo perché l'ambasciatore dei Cavalieri rivela l'esistenza della Torre di Guardia in orbita sopra la terra. Altrove, Capitan Atom assiste ad un incontro privato con l'ambasciatore dei Cavalieri e Black Canary intervista i membri della squadra e gli adolescenti rapiti dagli alieni, per scoprire lo scopo del loro rapimento. Blue Beetle alla fine decide di rivelare loro cosa potrebbe accadere in futuro a causa dello scarabeo che ha sulla schiena e chiedo loro di aiutarli a rimuoverlo.

Ascolti USA: telespettatori 1 596 000

Gli scarabei Titolo originale: True Colors Diretto da: Mel Zwyer Scritto da: Paul Giacoppo

Trama