– spin-off i sequel oryginalnego anime Yu-Gi-Oh! Duel Monsters i Yu-Gi-Oh! GX. Był emitowany w Japonii na kanale TV Tokyo w od 6 Kwietnia 2008 r. do 30 marca 2011 roku i jest sequelem serii Yu-Gi-Oh! GX, a zarazem prequelem do Yu-Gi-Oh! ZEXAL. Yu-Gi-Oh! 5D’s opowiada o losach Yusei'a Fudo, młodego gracza a zarazem mechanika. Ze względu na prośby o wyemitowanie serii „Yu-Gi-Oh! ZEXAL”, serię tę w dubbingu ograniczono do 123 zdubbingowanych odcinków, więc jest to druga seria (pierwszą było YGO GX), która nie została w pełni zdubbingowana. Na podstawie serialu powstały gry na Nintendo DS: „Yu-Gi-Oh! 5D’s: Stardust Accelerator”, „Reverse of Arcadia” i „Over the Nexus”. Podobnie jak w poprzednich sezonach, 4Kids ciężko zmodyfikowało tę serięPolskie nazwy kart, czy też innych nazw nie są oficjalne.. Sezon ten wprowadza do karcianki YGO nowy rodzaj przywołania: przywołanie synchroniczne.

Fabuła Seria 1: Walki Pucharu Fortuny Odcinki 1–13 Yusei Fudo, wytrawny gracz i mechanik z Satellite w końcu decyduje się udać do Nowego Miasta Domino, by odzyskać Smoka Gwiezdnego Pyłu, którego Jack Atlas, obecnie Król Turbo Walk go posiada. W tym celu używa swojego ścigacza, by przedostać się Rurociągiem do miasta, lecz kiedy dochodzi do konfrontacji dwóch graczy, tajemniczy czerwony smok się pojawia, w wyniku czego walka nie zostaje rozstrzygnięta. Yusei zostaje aresztowany przez Sektor Ochrony za przedostanie się do Miasta Domino bez zezwolenia i ląduje w Placówce, gdzie poznaje dawnego pro-gracza, Tannera oraz starego człowieka Yanagi, który ujawnia Yusei'owi historię o „Szkarłatnym Smoku” i o „Signerach”. W końcu toczy pojedynek z szefem Placówki i wygrywa, tym samym uwalniając wszystkich więźniów. Podczas próby odzyskania swojego Ścigacza dowiaduje się o bolącej przeszłości Blistera i dzięki walce z Trudge'm pomaga mu naprawić więź z przyjaciółmi. Yusei wygrywa pojedynek, lecz potem traci przytomność, i zostaje zabrany przez Leo i Lunę do ich mieszkania (W angielskiej wersji w wyniku wypadku Yusei ma amnezję, a Leo decyduje się walczyć z nim, by przywrócić mu pamięć). Odcinki 14–26 Yusei dowiaduje się od Lazara, asystenta Dyrektora Goodwina, że musi wziąć udział w turnieju Pucharu Fortuny, jeśli chce znów zobaczyć swoich przyjaciół. Nie mając innego wyboru, Yusei przystępuje do turnieju, gdzie poznaje między innymi Greigera, gracza którego wioska znikła przez eksperyment z Szkarłatnym Smokiem oraz tajemniczą Akizę Izinski, która okazuje się być Czarną Różą, zamaskowanym graczem zdolnym wywoływać prawdziwy ból u przeciwników. Nikt nie wie, iż ten turniej jest w rzeczywistości przykrywką, a tak naprawdę Goodwin planuje odnaleźć wszystkich Signerów. Po porażce innych przeciwników Yusei dowiaduje się więcej o Akizie: była ona uczennicą w Akademii Walk, lecz była odrzucana przez wszystkich ze względu na jej moce (uważała ona że to przez Znamię Szkarłatnego Smoka jest samotna), przez co stworzyła swoją mroczną stronę. Yusei walczy z nią i wygrywa, dochodząc do finałowego starcia z Jackiem. Na prośbę Jacka, Goodwin uwalnia Rally'ego i resztę z uwięzi, a Yusei i Jack toczą pojedynek o tytuł Króla Turbo Walk. Podczas starcia dwóch asów graczy pojawia się ponownie Szkarłatny Smok, który pokazuje Signerom wizję zniszczonego Satellite (później okazało się, że to wynik działań Mrocznych Signerów oraz „Earthbound Immortals”). Yusei Fudo w końcu pokonuje Jacka i zostaje nowym Królem Turbo Walk, choć jego myśli krążą wokół wizji, której doświadczył.

Seria 2: Earthbound Immortal Odcinki 27-42 Po finale Pucharu Fortuny, Yusei, Leo i Luna wraz z Blisterem i Tannerem dowiadują się od Yanagiego więcej o Signerach oraz o Szkarłatnym Smoku. W nocy Yusei staje do walki z graczem noszącym Znamię Pająka, i mimo Mrocznego Synchro-Potwora udaje mu się z nim wygrać. Tymczasem Jack po porażce z Yuseiem odpoczywa w szpitalu, lecz potem dzięki dziennikarce Carly przenosi się do jej domu, by ukryć swoją porażkę. Podczas pobytu z nią Jack zdaje sobie sprawę, że skrzywdził swoich przyjaciół swoim zachowaniem i za jej namową decyduje się iść własną ścieżką. Tymczasem Yusei rozmawia z Goodwinem i dowiaduje się, iż 5000 lat temu miała miejsce bitwa między Szkarłatnym Smokiem a Earthbound Immortals (Nieśmiertelnymi Wiązami Ziemi) oraz odkrywa że Zero Reverse stało się kluczme do otwarcia bram do Ciemności, a Satellite stanie się polem bitwy dwóch potężnych mocy. W końcu wraca do Satellite, gdzie spotyka swojego kumpla Crowa. Potem jednak spotyka dawnego przyjaciela, Kalina Kesslera, który stał się Mrocznym Signerem i przegrywa z nim pojedynek (choć udaje mu się z tego wyjść żywy, gdyż jego ścigacz się rozwalił przed przegraną). Tymczasem nad Nowym Domino City zbierają się czarne chmury, a Carly oraz Misty stają się też Mrocznymi Signerami, tym samym poszerzając chaos. Akiza przegrywa walkę z Yuseiem i decyduje się walczyć z nim przeciwko Mrocznym Signerom. Odcinki 43–64 Zespół Signerów wraca do Satellite, gdzie od razu spotykają Misty, Carly, Devacka, Kalina oraz ich lidera, Romana, który okazuje się być też starszym bratem Rexa Goodwina. Dowiadując się, że przed powstaniem Króla Ciemności mogą pomóc zapieczętowanie czterech jednostek Starego Reaktora Ener-D. Tak więc decydują się rozdzielić, by szybciej wykonać zadanie. Leo, dzięki pomocy Luny udaje mu się pokonać Devacka i odzyskać Starożytnego Baśniowego Smoka, a Roman zmienia Greigera w kolejnego Mrocznego Signera. Crow wówczas toczy z nim pojedynek, podczas którego Greiger odkrywa prawdę o swoich ludziach: okazuje się, że to nie Szkarłatny Smok odpowiadał za zniknięcie wioski, a Earthbonud Immortal Chacu Challhua. W końcu przegrywa pojedynek, przy tym ginąc (gdyż Mroczni Signerzy są tak naprawdę duszami zmarłych, którzy sprzedali swoją duszę złu, by się zemścić). Tymczasem Yusei toczy walkę z Kalinem, podczas której przeprasza Kalina za to, co się stało dwa lata temu i wygrywa pojedynek kosztem życia swojego przyjaciela; zaś Jack też pokonuje Carly, choć nie był z tego zadowolony. Niestety, pomimo zwycięstwa Akizy, nie udaje się zapieczętować ostatniej jednostki, a Król Ciemności powstaje ze Starego Reaktora. Wtedy Szkarłatny Smok teleportuje Signerów do posiadłości Goodwina, gdzie gospodarz ujawnia prawdziwy cel: zdobycie mocy Światła i Ciemności oraz zniszczenie świata i odbudowanie go na swoje podobieństwo. Yusei, Jack i Crow toczą ostateczny pojedynek, podczas którego Crow otrzymuje stare Znamię Yuseia, a zaś Yusei otrzymuje Znamię Głowy Szkarłatnego Smoka i wygrywa pojedynek, tym samym pokonując Króla Ciemności.

Seria 3: Droga do Przeznaczenia Odcinki 65-78 Mija pół roku od czasu wojny Signerów, a Satellite i Nowe Domino City znów zostały złączone. Jednakże pojawia się nowe zagrożenie: tajemniczy gracz „Duch” powoduje chaos dzięki potężnej karcie Meklorda, która posiada unikalną zdolność absorpcji Synchro-Potworów. Yusei'owi udaje się pokonać przeciwnika, który okazał się być robotem. Podczas kolejnych wzlotów i upadków Yusei i Akiza zostają wciągnięci w walkę z Sherry LeBlanc, kobietą-Turbo Graczem, której rodzina została zabita (porwana w dubbingu) przez tajemniczą grupę zwaną „Yliaster”. Akiza staje zafascynowana Turbo-Walkami i decyduje się stać jedną z Turbo-Graczy. Tymczasem Yusei powoli popada w wątpienie czy uda mu się pokonać Meklorda Wisela Nieskończości, kiedy nagle tajemniczy gracz „Vizor” wyzywa Yuseia na Turbo-Walkę, podczas której pokazuje mu zaawansowaną formę Synchro-Przyzwania: Accel Sycnhro. Yusei decyduje trenować, by lepiej przygotować się na starcie. Tymczasem sprawy miewają się gorzej, zwłaszcza kiedy członek Yliasterów, Lester, pokonuje Leo i Lunę dzięki innemu Meklordowi Skiel Nieskończoności; co więcej, wszystkie ślady o jego istnieniu zostają wymazane ze wspomnień kolegów z Akademii. Odcinki 79–92 Yusei powoli zaczyna sobie zdawać sprawę, że to Yliasterzy są odpowiedzialni za wszystko i planują użyć Światowych Wyścigów Grand Prix jako głównego celu. Tymczasem poznaje Bruno, człowieka z amnezją, lecz z zaskakującymi zdolnościami mechaniki. Wspólnie tworzą nowy program, który zostaje zabrany przez Lazara na polecenie nowych Dyrektorów: Jakoba, Primo i Lestera, lecz zostaje przez nich oszukany i ucieka. Jakiś czas później Yusei otrzymuje list od Barbary o sytuacji „przyjaciela” w Crash Town. Signer przyjeżdża do miasteczka na pustyni i odkrywa, że tym przyjacielem jest Kalin – obecnie poszukujący śmierci gracz pracujący dla Radleya. Nie mogąc pozwolić Kalinowi na taki krok, Yusei wchodzi w szeregi gangu Malcolma i pokonuje Kalina, lecz potem zostaje oszukany przez niego oraz Barbarę, która jest jego żoną i zostaje zabrany do kopalni. Tam Kalin Kessler przez poświęcenie ojca dwóch młodych dzieci decyduje wspólnie walczyć z Yuseiem, by wyzwolić Crash Town spod jarzma brata Malcolma, Lawtona. Ostateczny pojedynek zostaje przerwany przez oszustwo Barbary, lecz Jack i Crow z Sektorem Ochrony pojawiają się w samą porę i wyzwalają miasto (w oryginalnej wersji Kalin postanawia zakończyć walkę z Lawtonem i go pokonuje).

Seria 4: Światowe Wyścigi Grand Prix Odcinki 93–110 Odcinki 111–122Te odcinki nie zostały wyemitowane w innych krajach. Odcinki 123-134130 odcinek nie został wyemitowany poza Japonią.

Seria 5: Walka o Przyszłość Odcinki 135-145Tylko 135 i 136 odcinek zostały wyemitowane poza Japonią. Reszta odcinków nie została zdubbingowana Odcinki 146-154

Postacie Protagoniści Yusei Fudo – główny protagonista całej serii 5D's, młody człowiek, który dorastał w Satellicie. Kiedy udał się do Neo Domino City, by odzyskać Stardust Dragon'a, którego Jack ukradł 2 lata temu, odkrył iż jest jednym z Signerów noszących Znamię Karmazynowego Smoka. Pierwotnie nosił Znamię Ogona, lecz krótko przed zakończeniem walki z Rexem Godwinem jego pierwsze znamię zostało zastąpione Znamieniem Głowy Szkarłatnego Smoka. Jest chłodnym i cichym graczem, wierzy, że każda karta nie jest bezużyteczna. Ceni swoich przyjaciół ponad wszystko i jest gotów się poświęcić dla nich. Po ostatecznej walce z Yliasterami, Yusei postanawia zostać w Neo Domino City jako badacz. Yusei dysponuje kartami archetypu „Junk”, potworami często wyglądającymi jak roboty. Jego strategia często polega na przyzywaniu potwórów z niższego poziomu, by mógł dokonać Synchro Przyzwania potężniejszych potworów, z czego najbardziej zaufanym jest Junk Warrior. Jego atutową kartą jest Smok Gwiezdnego Pyłu, którego Jack ukradł 2 lata temu przed rozpoczęciem serii. Wraz z rozwinięciem akcji Yusei zdobywa też Majestatycznego Gwiezdnego Smoka (dzięki karcie „Majestatycznego Smoka”, potem Smoka Spadającej Gwiazdy (dzięki Z-ONE'a i „Czystego Umysłu”), a w ostatecznej konfrontacji z Z-ONE'm przywołuje Smoka Spadającego Kwazaru (za pomocą użycia 4 Smoków Signerów i Smoka Strumienia Życia jako synchro-Materiałów, oraz mocy Szkarłatnego Smoka). Według Z-ONE'a, Yusei z przyszłości posiadał Kosmicznego Smoka Blazaru.