Represje. Mord na byłych deputowanych do Konstytuanty Chociaż powstanie zostało szybko stłumione, już po ustaniu walk Pawieł Iwanow-Rinow wydał Armii Syberyjskiej rozkaz nadzwyczajny, w którym nakazywał sprowadzać wszystkich „prowokatorów” przed specjalne sądy poloweJ. D. Smele, Civil war…, s. 170.. Następnie ogłosił w Omsku stan wojenny. Adm. Aleksandr Kołczak, który był w tym czasie poważnie chory, dowiedział się o wydarzeniach od swojego szefa sztabu Dmitrija Lebiediewa i po południu tego samego dnia również nakazał sądzenie organizatorów powstania przez sądy wojskowe. W rzeczywistości Kołczak nie kontrolował poczynań swoich wojsk, a wydając rozkaz zamierzał sprawiać wrażenie, że mimo choroby w pełni panuje nad sytuacją.
Sądy wojskowe skazały na rozstrzelanie 166 osób, które natychmiast stracono nad brzegiem Irtyszu, zaś dalsze 37 skazał na karę ciężkich robót. Są to dane oficjalne, które mogą być zaniżone. Nie ma żadnych śladów, by ktokolwiek stanął przed sądem wojskowym w związku z podejrzeniem o udział w powstaniu i został uniewinniony.