Ocalała załoga podniosła bunt, chcąc odzyskać skrzynię i muszle jako rekompensatę za wszystkie trudności, nie wiedząc, że wyrzucono je za burtę. Kapitan zabił resztę załogi, a następnie przy ciele żony popełnił samobójstwo.
Kilka lat później agent ubezpieczeniowy (postać gracza) dowiaduje się o wszystkich wydarzeniach, badając statek, z wyjątkiem tych, które miały miejsce w afterpiku. Po powrocie na ląd wysyła ukończoną (lub nie) książkę pocztą na wskazany adres. Adresatem jest chirurg i autor książki, który poprosił agenta o zbadanie i dokończenie historii Obra Dinn, był również załogantem. Zależnie od sukcesu ustalenia losów załogi na statku, następuje jedno z dwóch zakończeń. W obu przypadkach gracz otrzymuje list od bliskiej osoby chirurga, ten jednak różni się treścią zależnie od uzupełnienia książki. List informuje o śmierci autora książki. Jeżeli gracz nie ustalił tożsamości i losów wszystkich możliwych wtedy osób, otrzymuje jedynie list. W przypadku wypełnienia zadania w całości, otrzymuje również paczkę, w której zawarta jest owa książka i łapa zabitej na statku małpy.