Mimo że Strażnicy Pokoju są uzbrojeni jak regularna armia, rząd Kostaryki nie może podjąć żadnych działań ze względu na ograniczenia konstytucyjne, które zabraniają utworzenia oficjalnej armii. Obecność tej grupy stanowi poważne zagrożenie dla globalnego porządku między Wschodem a Zachodem.
Postacie Podczas rozgrywki kierujemy poczynaniami Big Bossa, który przewodzi nowej grupie wojskowej. W tych dążeniach asystuje mu zastępca szefa, Kazuhira Miller. Dołączają oni później do FSLN, gdzie liderem rebeliantów jest Amanda Valenciano Libre i jej młodszy brat Ricardo „Chico” Valenciano Libre, Paz Ortega Andrade, studentka Uniwersytetu Pokoju, Dr. „Huey” Emmerich, ojciec Otacona i francuska ornitolożka Cécile Cosima Caminades. Głównym antagonistą jest Hot Coldman, szef CIA w Centralnej Ameryce, oraz Ramón Gálvez Mena, instruktor Paz. Dr.