IgA są skuteczne jako obrona przed drobnoustrojami chorobotwórczymi w przewodzie pokarmowym i oddechowymSaint-Marc, T., Blehaut, H., Musial, C., and Touraine, J.L. (1995). “AIDS-related diarrhea; a double-blind trial of Florastor® (Saccharomyces boulardii)”. Semaine des Hopitaux. 1995; 71, N° 23-24: 735-741..
Zapalenie jelita grubego i czasami cienkiego jest spowodowane infiltracją komórek T, które gromadzą się w węzłach chłonnych. S. boulardii zmniejsza stan zapalny poprzez kontrolowanie i ograniczanie infiltracji komórek T, szczególnie tych komórek T w obrębie jelita grubego. Dalsze badania sugerują alternatywne metody mechanizmu działania przeciwzapalnego drożdży. Stwierdzono, że S. boulardii wywiera działanie przeciwzapalne poprzez modulację sygnalizacji komórek gospodarza i ekspresji genów prozapalnych. W szczególności, drożdże probiotyczne są w stanie zablokować aktywację NF-kappaB i ekspresję genu IL-8 w komórkach nabłonka jelitowego, co skutkuje zmniejszeniem stanu zapalnego. W oddzielnym badaniu naukowcy odkryli, że S. boulardii może również modulować ekspresję receptora aktywowanego przez proliferatory peroksysomów gamma (ang. peroxisome proliferator-activated receptor gamma, PPARγ). Stymulacja ekspresji PPARγ przez S.