Miała dołączyć do wyprawy bezpośrednio przed wypłynięciem statku, udając, że nie zna Commersona.
Przed wyjazdem z Paryża Commerson sporządził testament, w którym pozostawił Jeanne Baret, znanej jako de Bonnefoi, moja gospodyni, ryczałt w wysokości 600 liwrów wraz z zaległymi pensjami i wyposażeniem ich paryskiego mieszkania. Istnieją więc dokumenty potwierdzające ich związek i jest wysoce prawdopodobne, że Commerson wymyślił przebranie Jeanne za mężczyznę. Nigdy jednak nie zawarli związku małżeńskiego.
W końcu grudnia 1766 Baret i Commerson dołączyli do wyprawy Bougainville'a w porcie Rochefort. Zostali przydzieleni do statku magazynowego Étoile. Ze względu na ogromną ilość sprzętu, który Commerson zabrał w podróż, kapitan statku François Chenard de la Giraudais, oddał dużą kabinę na statku Commersonowi i jego „asystentowi”. To dało Baret znacznie więcej prywatności niż na pokładzie zatłoczonego statku. Kabina kapitana dawała Baret dostęp do prywatnej toalety.