W październiku obaj udali się do Lagoa Santa, gdzie zamierzali przeczekać niesprzyjające warunki pogodowe, ale Lund zdecydował się kupić tam dom i spędził w nim kolejne 43 lata życia. W ciągu pierwszych 10 lat w Lagoa Santa, Lund przebadał wielką liczbę jaskiń. Już w 1836 r. udał się do kompleksów jaskiń w Fazenda do Mocambo, Cerca Grande i Sete Lagoas. W kolejnym roku Lund udał się ponownie do Fazenda do Mocambo i do Lapa do Baú. W 1839 r. rozpoczął eksplorację Sumidouro, po czym wrócił dokończyć prace w Cerca Grande. W 1840 r. po raz pierwszy odkrył skamieniałe szczątki ludzkie – miało to miejsce w Lapa do Sumidouro.
W 1841 r. Lund skoncentrował się na pracach w Baú i Sumidouro, a rok później w Baú i Escrivânia, jednak te ostatnie badania zostały przerwane z powodu lokalnych zamieszek. Najbardziej produktywny był rok 1843, w którym Lund odbył sześć wypraw, równocześnie eksplorując różne jaskinie. Jego największym projektem było oczyszczenie jaskini Sumidouro, co umożliwiło zbadanie jej geologii i odkrycie znajdujących się w niej szczątków ludzkich i zwierzęcych. Podczas ostatniego roku wykopalisk (1844 r.), Lund poświęcił się dokończeniu badań w Lapa da Escrivânia V i datowaniu tamtejszych znalezisk – które, jak szacował, należały do 56 gatunków.