Sieć hydrograficzną uzupełnia 7 jezior o łącznej powierzchni 1645 hektarów. Największe z nich, Palik (725 ha, największa głębokość – 2,1 m), stanowi naturalne przedłużenie koryta rzecznego Berezyny. Jeziora Olszyca (282 ha), Pławno (314 ha) i Manec (111 ha), ciągnące się łańcuchem o długości około 11 km z północy na południe, są połączone szerokimi kanałami utworzonymi przez przepływającą przez nie rzekę Sergucz. Rzeka Sergucz ponadto jest połączona krótkim kanałem z jeziorem Domżaryckim (191 hektarów), położonym na północno-zachodnich obrzeżach Bagna Domżaryckiego, największego na terenie rezerwatu. Osobliwe są najmniejsze jeziora – Moskowica (16 ha) i Postrzeskie (6 ha). Basen pierwszego jeziora wypełniony jest po brzegi sapropelem, natomiast drugie – położone w centrum masywu wysokich torfowisk o tej samej nazwie – jest jedynym bezodpływowym jeziorem na tym terenie. Wszystkie jeziora są płytkie (1,5 – 3 m), mocno zarośnięte. Dna są płaskie, pokryte sapropelem o grubości do 7 m.