27 sierpnia o godz. 19.00 batalion wymaszerował ze swojego miejsca mobilizacji i podjął marsz wraz 59 pp w kierunku miejsca koncentracji 15 DP. W trakcie przerwy w marszu w Jaksicach została odprawiona msza polowa i odbyła się przysięga. Następnie 6 b km i br. tow. odszedł w rejon wyczekiwania w pobliżu miejscowości Prądy, Miedzyń w okolicach Bydgoszczy. Prowadzono dalsze czynności organizacyjne oraz zgrywano pododdziały w batalionie oraz prowadzono szkolenie obsług broni zespołowej. Wieczorem 31 sierpnia batalion otrzymał rozkaz zajęcia stanowisk obronnych.
6 b km i br. tow. w kampanii wrześniowej
Walki w rejonie Bydgoszczy 1 września 1939 o świcie 1 kompania km zajmowała stanowiska w rejonie Osowej Góry na północny zachód od Bydgoszczy na odcinku 61 pułku piechoty. 2 kompania km wzmacniała batalion ON „Bydgoszcz” na pozycji obronnej Witoldowo, Wierzchucice, Wierzchucinek na północ od Bydgoszczy, w rejonie obrony 62 pułku piechoty. Reszta batalionu stanowiła odwód na pozycji zapasowej przedmościa bydgoskiego w gotowości do wykonania przeciwnatarcia. Tego dnia jedynie 2 kompania km od godz. 17.00 posiadła styczność bojową z niemieckimi oddziałami piechoty na odcinku 1 kompanii ON bydgoskiego batalionu ON.