W Polsce koordynowała projekty związane z otępieniami, takie jak: SHARED – Social Health And Reserve in the Dementia patient journey (2019–2022), COGNISANCE – Codesigning dementia diagnosis and post-diagnostic CarE (2019–2022), MEETINGDEM – Wdrożenie i walidacja pozytywnie ocenionego Programu Wsparcia – Centrum Spotkań dla osób z otępieniem oraz ich opiekunów w Europie (2013-2017).
Działalność organizacyjna Joanna Rymaszewska pełni funkcję przewodniczącej Komitetu Naukowego ogólnopolskiej konferencji Psychiatria – Dialogi interdyscyplinarne organizowanej we Wrocławiu od 2016 r.
Jest członkinią zarządów międzynarodowych towarzystw naukowych: European Association of Psychosomatic Medicine, INTERDEM (Network of researchers on Psychosocial Interventions in Dementia).
Pełniła funkcję wiceprezeski Polskiego Towarzystwa Psychiatrycznego (2019–2022). Od 2023 r. należy do grona naukowców Academia Europaea.