Narzeczoną Karola była Marianna Michalina Rogalewiczówna (1828–1846), córka Tomasza Rogalewicza, uczestnika powstania listopadowego, oraz Antoniny z Głuchowskich. Uczestniczyła w działalności niepodległościowej i środowiskach emancypacyjnych, określanych jako krąg „entuzjastek”. Wraz z Karolem angażowała się w pomoc dla więźniów politycznych.
Po rozbiciu spisku księdza Ściegiennego Klatt został aresztowany i osadzony w warszawskiej Cytadeli. Początkowo uznawano go za jednego z mniej znaczących konspiratorów, jednak w toku śledztwa jego rola zaczęła być oceniana jako bardziej istotna. Według relacji Dawida Fajnhauza, Klatt w rozmowie z jednym ze współwięźniów, który okazał się donosicielem, ujawnił informację o składzie broni ukrytej przez Henryka Kamieńskiego, co przyczyniło się do jego skazaniaMarek Klat, Klat albo Klatt. Oto jest pytanie…, Gdańsk–Wrocław 2025, s. 36–37..
W lutym 1846 roku Marianna Rogalewiczówna wraz z matką zostały aresztowane podczas próby odebrania grypsu, który Klatt wyrzucił z okna Cytadeli. W wyniku przesłuchań i złego stanu zdrowia Marianna zmarła 12 marca 1846 roku, dziesięć dni po zwolnieniu z więzienia.