Metody i taktyka prześladowań Taktyka zmieniała się na przestrzeni lat, okresowo ulegając złagodzeniu lub zaostrzeniu. Do powszechnie stosowanych metod należały: konfiskata mienia kościelnego, ośmieszanie religii, szykanowanie wierzących oraz propagowanie ateizmu poprzez system edukacji. Działania wymierzone w poszczególne wyznania były determinowane interesem państwa, a większość nigdy nie została formalnie zdelegalizowana.
Działania skierowane przeciwko prawosławnym duchownym i wiernym obejmowały tortury, egzekucje oraz osadzanie w obozach więziennych, łagrach i szpitalach psychiatrycznych. Wielu wyznawców prawosławia (obok przedstawicieli innych wyznań) poddawano również karom psychologicznym oraz eksperymentom z zakresu kontroli umysłu, mającym na celu zmuszenie ich do wyrzeczenia się przekonań religijnych. W ciągu pierwszych pięciu lat po rewolucji październikowej bolszewicy rozstrzelali 28 biskupów i ponad 1200 księży Rosyjskiego Kościoła Prawosławnego. Wielu innych uwięziono lub zesłano.
Kościół luterański w Związku Radzieckim również był poddawany prześladowaniom;