Gra oferuje cztery poziomy trudności: łatwy, umiarkowany, trudny oraz niestandardowy. Ostatni z nich umożliwia szerokie dostosowanie parametrów rozgrywki poprzez modyfikację właściwości generowanego lochu. Gracz może określić liczbę poziomów podziemi (od 10 do 25), siłę występujących przeciwników, częstotliwość pojawiania się skarbów, żywności oraz pułapek magicznych, a także skuteczność czarów postaci. Dodatkowo możliwe jest włączenie lub wyłączenie wybranych elementów rozgrywki, takich jak obecność nieumarłych, przeciwników posługujących się magią czy pułapek wielopoziomowych.
Jedną z dostępnych opcji jest także tryb „Character Death Real”, odpowiadający zasadzie trwałej śmierci postaci (permadeath). W przypadku śmierci bohatera wszystkie zapisy stanu gry są usuwane, co uniemożliwia kontynuowanie rozgrywki z wcześniejszego punktu i wymusza rozpoczęcie nowej gry.
Mechanika i cechy charakterystyczne Dungeon Hack wprowadzał szereg rozwiązań odróżniających go od klasycznych gier typu roguelike. Produkcja nie zawierała zagadek w tradycyjnym znaczeniu tego terminu;