Gardło pokrywa rzadki włos. Boki szyi są gruczołowate. Mają barwę ciemnego żółtawego brązu.
Na grzbiecie futro jest dłuższe, bardziej wełniste i jeszcze ciemniejsze, na bokach bardziej brązowe. Podobnie jest na podstawach przedramion. Klatka piersiowa i brzuch zabarwione są barwą mysią, a rosną na nich miękkie włosy o brązowych końcach.
Uropatagium, szerokie u niektórych innych Balionycterini, jak dajakolot filipiński, u owocnika borneańskiego ograniczone jest do paska. Na obu powierzchniach porasta je gęste owłosienie barwy ciemnego cynamonowego brązu. Nie występuje ostroga.
Występują białe pazury.
Goleń pokrywa gęste cynamonowobrązowe ciemne futro.
Błony skrzydeł owocnika borneańskiego również są czarne, a przyczepiają się pomiędzy pierwszym i drugim palcem stopy.
Systematyka thumb|left|Owocnik borneański należy do plemienia Balionycterini, biorącego swą nazwę od rodzaju Balionycteris, czyli skrzydłoplamek. Na zdjęciu powyżej skrzydłoplamek karłowaty Nowy gatunek nietoperza opisał pod obecnie używaną nazwą gatunkową G.M. Allen w 1938 roku. Autor jako miejsce typowe podał „Lumu Lumu, góra Kinabalu, brytyjskie Borneo Północne, na wysokości 5,5 tysiąca stóp”. Odpowiada to wysokości 1676 m nad poziomem morza i znajduje się w Sabah na terenie Malezji.