Uczelnię przeniesiono wówczas do poklasztornego kompleksu Santa Maria della Carità, obejmującego dawny kościół, klasztor i siedzibę bractwa Scuola Grande della Carità.
Do akademii przyłączono kolekcję dzieł dawnych mistrzów, tworzoną z prac dydaktycznych, darowizn, zapisów i dzieł przejmowanych z likwidowanych instytucji kościelnych. Zbiór ten dał początek muzeum Gallerie dell’Accademia, którego kolekcja obejmuje przede wszystkim malarstwo weneckie od XIV do XVIII wieku.
W 1879 roku rozdzielono administracyjnie działalność dydaktyczną akademii od działalności muzealnej galerii. Obie instytucje nadal zajmowały jednak wspólny kompleks Santa Maria della Carità. Taki stan utrzymywał się do początku XXI wieku, kiedy wzrost liczby studentów i potrzeb lokalowych obu instytucji doprowadził do przeniesienia uczelni.
W wyniku reformy włoskiego szkolnictwa artystycznego z 1999 roku akademia została włączona do systemu wyższego kształcenia artystycznego, muzycznego i tanecznego. Uzyskała prawo prowadzenia studiów pierwszego i drugiego stopnia oraz nadawania dyplomów równoważnych odpowiednio stopniom licencjackim i magisterskim.