Działalność po 1989 Po ogłoszeniu w 1990 r. likwidacji RSW „Prasa-Książka-Ruch”, „Czytelnik” zgłosił do komisji likwidacyjnej roszczenia do części jej majątku. W planie zaspokojenia roszczeń komisja likwidacyjna za uzasadnione uznała jedynie roszczenia „Czytelnika” do 17 tytułów prasowych, ale wyłącznie niemajątkowe i w zamian za odstąpienie od tych roszczeń zaproponowano mu udziały w kilku spółkach. Odmówiono „Czytelnikowi” zwrotu majątku w części prasowej i kolportażowej. Kontrola NIK wykazała, że 3 z 4 zobligowanych do tego spółdzielni nie utworzyło spółek z SW „Czytelnik” („Czytelnik” miał dostać od spółdzielni 20% udziału w tych spółkach). Raport końcowy komisji likwidacyjnej wskazał na oddanie spółdzielni „Czytelnik” kilku kamienic, w zamian za zrzeczenie się roszczeń do tytułów.
W latach 90. XX wieku i na początku XXI wieku sprzedaż wydawnictwa malała. W 2017 miało 440 tys. złotych straty. Prezesem zarządu został wtedy Marian Sewerski, menedżer z doświadczeniem z koncernów paliwowych. W 2022 spółdzielnia miała 4,19 mln zł przychodów i 369 tys. zł zysku.
W latach 2005–2012 redaktorem naczelnym wydawnictwa był Janusz Drzewucki.