Podkreślał także, że przeprowadzanie takich operacji powinno należeć wyłącznie do Wehrmachtu, który dotąd konsekwentnie strzegł swojej wyłącznej roli w prowadzeniu działań wojskowych na terenach przygranicznych. Mimo jego zastrzeżeń, Heydrich powoływał się na bezwzględny charakter rozkazu Hitlera, który nie podlegał dyskusji. Zaproponował Mehlhornowi objęcie ogólnego kierownictwa nad operacją. Ten jednak, wykazując niechęć wobec planu, nie otrzymał ostatecznie tej funkcjiNależy zauważyć, że po odmowie bezpośredniego udziału w prowokacjach granicznych, Heydrich przesunął Mehlhorna na niższe stanowisko administracyjne oraz ograniczył jego zadania jedynie do kontroli oraz nadzoru planów akcji „Stodoły” i „Byczyna”. Udział Mehlhorna ograniczać miał się jedynie do konsultacji sztabowych w wątpliwych sprawach.
9 sierpnia 1939 roku przyleciał samolotem Ju 52 na lotnisko polowe w Prudniku na Górnym Śląsku po czym oświadczył przybyłemu na spotkanie szefowi Gestapo w Opolu , że Führer potrzebuje pretekstu do rozpętania wojny, po czym zaproponował omówienie sprawy w bardziej dyskretnym miejscu. Wszyscy (t.j. , oraz przybyli z nim adiutant oraz ) spotkali się w hotelu w Gliwicach, gdzie zatrzymały się również inne osoby zaangażowane w planowanie akcji.