Warto zauważyć, że na San Siro Dinamo przez trzy minuty po wyrównaniu przez Gianniego Comandiniego prowadziło 1:0, a bramkę w 20 minucie zdobył właśnie Pilipović. Później „Modri” występowali w rozgrywkach Pucharu UEFA. Warto zauważyć, że w rozgrywanym w Bratysławie meczu przeciwko Slovanowi Bratysława Pilipović strzelił bramkę na 3:0, ustalając tym samym wynik tego spotkania. Ogółem Pilipović pojawił się na boisku w sezonie 23 razy i zdobył 2 gole dla „Niebieskich”. Sezon 2001/2002 nie był jednak tak udany jak poprzedni sezon, Dinamo zajęło 3. miejsce na finiszu rozgrywek ligowych i przegrali z dwoma odwiecznymi rywalami – NK Zagrzeb i Hajdukiem Split. Niepowodzenia ligowe pomścili jednak w Pucharze Chorwacji w którym triumfowali po kolei pokonując Zeljeznicar Slavonski Brod po wygranej 3:0 na wyjeździe, Kamen Ingrad Velika na wyjeździe 4:1, w ćwierćfinale NK Rijeka u siebie i na wyjeździe 1:0, w półfinale pokonali NK Osijek. W pierwszym meczu przegrali 1:2 na wyjeździe, a kontaktowego gola dającego nadzieję na awans dla Dinama zdobył z karnego w 30 minucie Dario Smoje. W rewanżu Dinamo wygrało 2:0 po dwóch golach Jasmina Agicia. W finale udało się triumfować nad zespołem NK Varteks po remisie na Maksimirze 1:1 i wygranej na wyjeździe 1:0. Pilipović pojawił się na boisku 18 razy, zdobył także 3 gole.