Marek Sanak jest członkiem Rady Redakcyjnej czasopisma Allergy (najwyżej notowanego europejskiego czasopisma alergologicznego), miesięcznika Medycyna Praktyczna, dwumiesięcznika Medycyna Praktyczna. Pediatria oraz kwartalnika Wszechświat (najstarszego polskiego czasopisma przyrodniczego). Znalazł się w opublikowanym w październiku 2021 rankingu uwzględniającym ponad 180 tys. (2%) najlepszych naukowców na świecie, gdzie został sklasyfikowany na 108.899 pozycji. Ranking oceniał dorobek naukowy na podstawie indeksu bibliometrycznego z uwzględnieniem indeksu Hirscha, liczby cytowań, Impact Factor, miejsca i roli na liście autorów.
Marek Sanak jest aktywnym nauczycielem akademickim. Od 2003 wykłada w Studium Kształcenia Podyplomowego Wydziału Farmaceutycznego Uniwersytetu Jagiellońskiego. Od 2005 prowadzi kurs dla słuchaczy Wydziału Biotechnologii UJ. Od 2006 prowadzi również zajęcia dla studentów Wydziału Lekarskiego i Szkoły Medycznej dla Obcokrajowców CMUJ. Pod jego opieką promotorską ukończone zostało czternaście przewodów doktorskich. Był promotorem w jednym przewodzie habilitacyjnym. Moderował dyskusje i wykładał w ramach Kawiarni Naukowej Polskiej Akademii Umiejętności.