CIA w końcu łapie Jodie po tym, jak próbuje ona dotrzeć do jej biologicznej matki, będącej od lat w farmakologicznie podtrzymywanym stanie katatonii i przetrzymywanej w szpitalu wojskowym.
CIA przekazuje Jodie z powrotem do Nathana, który w międzyczasie awansował na dyrektora wykonawczego Instytutu Zjawisk Paranormalnych i nadzorował prace nad nowszą wersją kondensatora, noszącego kryptonim Czarne Słońce. Zdradza on, że CIA obiecało Jodie wolność w zamian za wykonanie ostatniej misji. Jodie wraz z zespołem agentów CIA pod dowództwem Ryana musi zniszczyć kompleks, w którym Chińczycy budują własną wersję kondensatora, planując za jego pomocą atak na USA. Po powrocie z zakończonej sukcesem misji Jodie, uznana przez CIA za zbyt groźną aby przebywać na wolności, zostaje podstępem wprowadzona w stan śpiączki farmakologicznej, podobnie jak wcześniej jej matka. Pewnego dnia pojawia się przy niej Nathan, który cały czas nie może pogodzić się ze śmiercią swojej rodziny. Zdradza on jej, że za pomocą Czarnego Słońca zamierza połączyć oba światy, żywych i umarłych, co ma według niego sprawić, że śmierć przestanie mieć jakiekolwiek znaczenie. Aiden, będąc zbyt słabym by samodzielnie uwolnić Jodie, kontaktuje się z przebywającymi w pobliżu Ryanem i Cole’em, prowadząc ich do niej.