W tym czasie okrył się niesławą biorąc czynny udział w zdobyciu wyspy Rathlin, gdzie pozwolił na wymordowanie jej obrońców, a także ich rodzin składających się z kobiet, dzieci i starców.

Wyprawa dookoła świata thumb|500px|left|Wyprawa Francisa Drake’a dookoła świata W 1577 na polecenie królowej Elżbiety Drake podjął wyprawę przeciw hiszpańskim posiadłościom na zachodnim wybrzeżu Ameryki. Wyprawa ta przekształciła się w wyprawę dookoła świata – drugą po wyprawie Magellana. Drake był jednak pierwszym kapitanem, który opłynął kulę ziemską, gdyż Magellan zginął podczas swojej wyprawy. Drake wypłynął w grudniu 1577 z Plymouth w Anglii z ponad 150 ludźmi załogi i pięcioma statkami: galeon „Pelican” przemianowany później na „Golden Hind” (150 ton, 18 armat), okręt flagowy dowodzony przez Drake’a, galeon „Elizabeth” (80 ton, 16 armat) dowodzony przez Johna Wintera, karawela „Marigold”' (30 ton, 16 armat) dowodzona przez Johna Thomasa (niektóre źródła podają, że był to bark), karaka „Swan” (50 ton, 5 armat) dowodzona przez Johna Chestera, pinka „Christopher” (15 ton, 1 armata) dowodzona przez Toma Moone’a.