Homolog kornihonskog proteina je protein koji je kod ljudi kodiran genom CNIH.
Scott (2007) je locorao gen CNIH na poziciji 14q22.2 hromosoma 14, na osnovu popravnanja sekvence CNIH (GenBank AC099790) sa genomskom sekvencom (36.2).Scott, A. F. Personal Communication. Baltimore, Md. 7/18/2007.
Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 144 aminokiseline, a molekulska težina 16.699 Da.
1020304050 MAFTFAAFCYMLALLLTAALIFFAIWHIIAFDELKTDYKNPIDQCNTLNP LVLPEYLIHAFFCVMFLCAAEWLTLGLNMPLLAYHIWRYMSRPVMSGPGL YDPTTIMNADILAYCQKEGWCKLAFYLLAFFYYLYGMIYVLVSS Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
Kloniranje i ekspresija U potrazi za genima induciranim tokom rane faze aktivacije T-ćelija, Utku et al. (1999) identificirali su ljudski homolog Drosophila cornichon (cni). Diferencijalnim prikazom RT-PCR proizvoda dobili su fragment koji je korišten za identifikaciju kompletne cDNK CNIH-a, koju su označili kao TGAM77. CNIH kodira izvedeni protein od 134 aminokiseline sa 63% homologije sa proteinom vinske mušice. Northern blot analizom otkriven je 1,4-kb CNIH transkript na visokim nivoima u srcu, jetri, skeletnim mišićima, gušterači, kori i srži nadbubrežnih žlijezda, štitnjači, sjemenicima, slezeni, slijepom crijevu, limfocitima periferne krvi i koštanoj srži, te na niskim nivoima u mozgu, posteljici, plućima, bubrezima, jajnicima, tankom crijevu, želucu, limfnim čvorovima, timusu i fetusnoj jetri.
Castro et al. (2007) klonirali su ljudski CNIH pune dužine i otkrili da kodira izvedeni protein od 144 aminokiseline. Poput homologa drozofile i kvasca, sadrži tri transmembranska domena (TMD). Prva predviđena petlja između TMD1 i TMD2 ima tri konzervirana kiselinska ostatka i predviđa se da će se sučdeliti s lumenom endoplazmatskog retikuluma. Predviđa se da će segment između TMD2 i TMD3 biti u citosolu.
Funkcija gena Northern blot i RT-PCR analizom, Utku et al. (1999) potvrdili su regulaciju CNIH tokom aktivacije T-ćelija.Utku, N., Bulwin, G.-C., Beinke, S., Heinemann, T., Beato, F., Randall, J., Schnieders, B., Sandhoff, K., Volk, H.-D., Milford, E., Gullans, S. R. The human homolog of Drosophila cornichon protein is differentially expressed in alloactivated T-cells. Biochim. Biophys. Acta 1449: 203-210, 1999. PubMed: 10209299
Bokel et al. (2006) pokazali su da je Drosophila cornichon član konzervirane porodice proteina koja uključuje Erv14p, protein kvaščeve membrane potreban za aksijalno pupanje koji je dio ranog sekretornog puta i javlja se u vezikulama proteinskog sloja II (COPII). Kod Drosophila, cni je potreban za transport TGF-alfa faktora rasta gurken (Grk) do površine oocita i najvjerojatnije regrutuje Grk u vezikule COPII.Bokel, C., Dass, S., Wilsch-Brauninger, M., Roth, S. Drosophila cornichon acts as cargo receptor for ER export of the TGF-alpha-like growth factor gurken. Development 133: 459-470, 2006. PubMed: 16396907
Castro et al. (2007) pokazali su da je ljudski CNIH nadopunio gubitak Erv14p u kvascu. Eksperimenti imunofluorescencije pokazali su da su ljudski proteini i proteini Drosophila primarno lokalizirani u endoplazmatskom retikulumu, gdje se povezuju sa nezrelim (tj. neglikoziliranim) proteinima povezanim s TGF-alfa. TGF-alfa proteini se prvo sintetišu kao transmembranski proteini tipa I sa venćelijskim EGF domenskom jezgrom koje je potrebno za vezivanje i aktivaciju receptora. Da bi se dobio topljivi oblik u sekretornom Golgijevom putu uklanja se ektodomen, nakon transporta iz ER. Prekomjerna ekspresija CNIH uzrokovala je zadržavanje TGF-alfa proteina u ER. Zaključili su da je protein kornihon potreban za selektivni transport i sazrijevanje TGF-alfa proteina.Castro, C. P., Piscopo, D., Nakagawa, T., Derynck, R. Cornichon regulates transport and secretion of TGF-alpha-related proteins in metazoan cells. J. Cell Sci. 120: 2454-2466, 2007. PubMed: 17607000
Schwenk et al. (2009), proteasomskom analizom, demonstrirali su da se većina AMPA receptora u mozgu pacova spaja sa dva člana porodice kornihonskih transmembranskih proteina, umjesto sa transmembranskim regulatornim proteinima AMPA receptora (TARP). Sklapanje homologa kornihona 2 (CNIH2; 611288) i CNIH3 utiče na AMPA receptore na dva načina: kornihoni povećavaju površinsku ekspresiju AMPA receptora i mijenjaju prolazak kanala, značajno usporavajući kinetiku deaktivacije i desenzibilizacije. Zaključili su da su njihovi rezultati pokazali da su kornihoni suštinske pomoćne podjedinice nativnih AMPA receptora i pružaju molekulske odrednice za glutamatergijsku neurotransmisiju u centralnom nervnom sistemu.Schwenk, J., Harmel, N., Zolles, G., Bildl, W., Kulik, A., Heimrich, B., Chisaka, O., Jonas, P., Schulte, U., Fakler, B., Klocker, N. Functional proteomics identify cornichon proteins as auxiliary subunits of AMPA receptors. Science 323: 1313-1319, 2009. PubMed: 19265014
Reference
Dopunska literatura
Vanjski linkovi
Kategorija:Geni na hromosomu 14 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika