TMEM222

Transmembranski protein 222 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom TMEM222 sa hromosoma 1. Jedna od značajnih karakteristika proteina koji je kodiran ovim genom je prisustvo tri predviđena transmembranska domena.TMHMM Predviđa se da se protein TMEM222 najvjerovatnije nalazi u sekretornim vezikulama.k-NN

Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 208 aminokiselina, a molekulska težina 23.230 Da.

1020304050 MAEAEGSSLLLLPPPPPPPRMAEVEAPTAAETDMKQYQGSGGVAMDVERS RFPYCVVWTPIPVLTWFFPIIGHMGICTSTGVIRDFAGPYFVSEDNMAFG KPAKYWKLDPAQVYASGPNAWDTAVHDASEEYKHRMHNLCCDNCHSHVAL ALNLMRYNNSTNWNMVTLCFFCLLYGKYVSVGAFVKTWLPFILLLGIILT VSLVFNLR

Genska svopjstva

TMEM222 ima domen nepoznate funkcije (DUF778).NCBI (National Center for Biotechnology information) Aliases of this gene include DKFZP564D0478, RP11-4K3__A.4, C1orf160, and MGC111002.Gene Cards Pristupom NM_032125.2, vidi se da najduža kodirajuća sekvenca (1.629 bp), kodira protein od 208 aminokiselinskih ostataka (2.230 Da), koja se smatra konsenzusnom kodirajućom sekvencom (CCDS297.2).Uniprot Slični su osim što drugom (Q9H0R3-2) nedostaje prvih 96 aminokiselinskih ostataka koji su prisutni u prvom (Q9H0R3-1).Uniprot

Ekspresija gena

ACEVIEW je označio TMEM222 kao visoko eksprimiran sa 3,8 puta većom ekspresijom od prosječnog gena u bazi podataka.ACEVIEW Postoje dokazi ekspresije iz 166 tkiva uključujući mozak, pluća, debelo crijevo, bubrege i placenta.

Homologija

Ortolozi i udaljeni homolozi ljudskog TMEM222 identificirani su širom eukariota, posebno kod biljaka i životinja.Homologene No paralogs of this gene have been found in the human genome.BLAST Rod I vrsta Uobičajeno ime Pristupni broj Dužina Slčnost Identitet sa ljudskim Rattus norvegicus Pacov NP_001107252.1 208aa 99% 96% Canis familiaris Pas XP_852505.1 208aa 98% 96% Mus musculus Miš NP_079943.2 208aa 96% 95% Sus scrofa Svinja XP_003127773.1 208aa 97% 94% Equus caballus Konj XP_001917747.1 207aa 94% 93% Gallus gallus Kokoš XP_417729.1 182aa 90% 85% Danio rerio Zebrica NP_001013334.1 174aa 83% 71% Anopheles gambiae Komarac XP_320483.3 197aa 66% 53% Drosophila melanogaster Fruit Fly NP_723362.1 196aa 74% 61% Caenorhabditis elegans Nematoda NP_494762.2 168aa 72% 55% Phytophthora infestans Kasna pjegavost (gljiva) XP_002902629.1 186aa 59% 48% Zea mays Kukuruz NP_001144071.1 233aa 61% 44% Oryza sativa Riža NP_001051577.1 204aa 61% 43% Arabidopsis thaliana Thallova grbaštica NP_190673.1 231aa 55% 36% Homo sapiens Čovjek NP_115501.2 208 - -

Udaljeni homolog

Daleki homolog TMEM222, RTH (RTE1-Homolog), je homolog RTE1 (reverzija percepcije etilena 1), za koji je poznato da izaziva konformacijske promjene u ETR1 (Etilenski receptor 1) koje rezultiraju negativnom regulacijom koja odgovara gubitku percepcije etilena.

Proteinske interakcije

Postoje dokazi iz kvaščevog dvohibridnog pregleda za dvije interakcije proteina sa ovim genom. Jedna je serinska proteaza (PRSS23) za koju je utvrđeno da sudjeluju u ovulacijama miša i izlučuju se u vanćelijski matriks. Drugi protein je ab-hidrolaza (HLA-B vezani transkript 5) koji je sastavni dio membrane, a njegov odgovarajući gen se nalazi u genomu u blizini faktora tumorske nekroze (TNF)-alfa i TNF-beta.

Reference

Dopunska literatura

Kategorija:Geni na hromosomu 1 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika Kategorija:Nekarakterizirani proteini