thumb|200px|Le département du Doubs en rouge sur la carte La liste des sites classés du Doubs présente les sites naturels classés et inscrits du département du Doubs. Ils sont gérés par la DREAL de Franche-Comté. Le dossier de classement est instruit par la Direction Régionale de l’Écologie de l'Aménagement et du Logement. Le classement intervient par arrêté du Ministre chargé des sites ou par décret en Conseil d’État. L’inscription est prononcée par arrêté du Ministre chargé des sites.
Au , le département compte 46 sites classés. répartis sur 51 communes. et 68 sites inscrits qui concernent 96 communes.
Critères Compte tenu de leur nature, les sites sont classables d'après un ou plusieurs des cinq critères ci-après :
P : Pittoresque A : Artistique S : Scientifique H : Historique L : Légendaire La plupart d'entre eux sont toutefois classés tous critères (TC)
Liste des sites classés Nota : Certains sites sont pluri-communaux. D'autres ont fait l'objet de plusieurs arrêtés. Commune Site classé Date du classement Critère de classement Géolocalisation Superficie(ha) Autres labels IllustrationBaume-les-Dames, Pont-les-Moulins, Guillon-les-Bains, CusanceLa vallée du Cusancinhttp://www.donnees.franche-comte.developpement-durable.gouv.fr/infos_geo/fiches_cartes/sites/sites_fiches/Fiche_SC0095.pdfDécret du P803,96BelvoirLe château de Belvoirhttp://www.donnees.franche-comte.developpement-durable.gouv.fr/infos_geo/fiches_cartes/sites/sites_fiches/Fiche_SC0260.pdfDécret du H et P 46,72 100pxBesançonLa citadelle.Arrêté du 9,29100pxLa citadelle vue de la percée située devant la gare Viotte.Arrêté du TC8,84100pxParc et table de pierre historique au 32 avenue de Montrapon au lieu-dit "Grange Huguenet".Arrêté du TC4,59100pxLa partie nord du cimetière des Chaprais.Arrêté du TC1,59100pxLes parties de l'île de Malpas comprenant les parcelles 815, 816, 818 à 822, 830 section D.Arrêté du TC1,41100pxLes terrains avoisinant le site de la Roche d'Or.Arrêté du TC5,25100pxBeureLa cascade du Bout du Monde.Arrêté du TC0,92100pxBonnevaux-le-Prieuré, Charbonnières-les-Sapins, Chassagne-Saint-Denis, Foucherans, Malbrans, Ornans, Saules, Scey-MaisièresL'ensemble formé par les falaises d'Ornans et la vallée de la Brêmehttp://www.donnees.franche-comte.developpement-durable.gouv.fr/infos_geo/fiches_cartes/sites/sites_fiches/Fiche_SC0022.pdfDécret du P et S2180,2100pxBournoisLes grottes de la Baume.Arrêté du TC7,08100pxBretonvillers, Plaimbois-du-MiroirLe site de Gigothttp://www.donnees.franche-comte.developpement-durable.gouv.fr/infos_geo/fiches_cartes/sites/sites_fiches/Fiche_SC0150.pdfArrêté du A0,75100pxChamesolLes grottes et le château de La Roche.Arrêté du TC2,88133x133pxCharquemontLes rochers de la Cendrée, situés en bordure de la RN 464, parcelle 74 section C, lieu-dit La Cendréehttp://www.donnees.franche-comte.developpement-durable.gouv.fr/infos_geo/fiches_cartes/sites/sites_fiches/Fiche_SC0065.pdfDécret du P4,67100pxChassagne-Saint-Denis, CléronLes ruines du Castel Saint-Denis.Arrêté du TC9,34 Chaux-lès-PassavantLa grotte de la glacièrehttp://www.donnees.franche-comte.developpement-durable.gouv.fr/infos_geo/fiches_cartes/sites/sites_fiches/Fiche_SC0078.pdfArrêté du A7,08100pxChenecey-BuillonLes grottes de Chenecey-Buillon.Arrêté du TC0,14100pxLes CombesLe trésor et les grottes de Remonothttp://www.donnees.franche-comte.developpement-durable.gouv.fr/infos_geo/fiches_cartes/sites/sites_fiches/Fiche_SC0089.pdfArrêté du TC7,07Les gorges de Remonot, au lieu-dit la Grottehttp://www.donnees.franche-comte.developpement-durable.gouv.fr/infos_geo/fiches_cartes/sites/sites_fiches/Fiche_SC0047.pdfArrêté du TC7,08100pxCrouzet-Migette, Sainte-AnneLe pont du Diable.Arrêté du TC7,08Crouzet-Migette, Nans-sous-Sainte-AnneLe Creux Billard, la source du Lison et la grotte Sarrazinehttp://www.donnees.franche-comte.developpement-durable.gouv.fr/infos_geo/fiches_cartes/sites/sites_fiches/Fiche_SC0094.pdfArrêté du A1,8EtalansLe puits de Poudrey, situé dans la parcelle 738 sectionhttp://www.donnees.franche-comte.developpement-durable.gouv.fr/infos_geo/fiches_cartes/sites/sites_fiches/Fiche_SC0211.pdfArrêté du TC13,58100pxFourcatier-et-Maison-NeuveLes cascades du Doubs, dans la partie de la rive droite appartenant à la commune.Arrêté du 7,07100pxGondenans-MontbyLes grottes de Gondenans-Montby, situées dans la parcelle 52.Arrêté du TC1,39100pxLes Hôpitaux-Vieux, Montperreux, Touillon-et-LouteletLe ruisseau et la vallée de Fontaine-Rondehttp://www.donnees.franche-comte.developpement-durable.gouv.fr/infos_geo/fiches_cartes/sites/sites_fiches/Fiche_SC0107.pdfArrêté du A150,59100pxJallerangeLe parc du château de Jallerange.Arrêté du TC3,93La Longeville, Ville-du-PontLes parties du défilé d'Entre-Roches comprenant les rives du Doubshttp://www.donnees.franche-comte.developpement-durable.gouv.fr/infos_geo/fiches_cartes/sites/sites_fiches/Fiche_SC0116.pdfArrêté du TC30,97100pxLorayLe vieux tilleul.Arrêté du TC100pxMandeureLe théâtre romain.Arrêté du TC0,95100pxMontbéliardLa citadellehttp://www.donnees.franche-comte.developpement-durable.gouv.fr/infos_geo/fiches_cartes/sites/sites_fiches/Fiche_SC0126.pdfDécret du TC4,46Les ex huit gros arbres situés sur le haut plateau du parc dominant au nord la ville, parcelle 364 section B.Arrêté du TC7,08100pxMontferrand-le-ChâteauLes ruines du château de Monferrand, parcelle 1268p, section C.Arrêté du TC0,93100pxMontjoie-le-ChâteauLes ruines du château de Montjoie, parcelle 29 section A.Arrêté du TC0,43MontperreuxLa source Bleue et sa cascadehttp://www.donnees.franche-comte.developpement-durable.gouv.fr/infos_geo/fiches_cartes/sites/sites_fiches/Fiche_SC0133.pdfArrêté du A3,99Mouthier-Haute-Pierre, OuhansL'ensemble formé par les Gorges de Nouailles, la source de la Loue, le cours de la Loue en amont de l'usine électrique, la source du Pontet et la grotte des Faux-Monnayeurshttp://www.donnees.franche-comte.developpement-durable.gouv.fr/infos_geo/fiches_cartes/sites/sites_fiches/Fiche_SC0140.pdfArrêté du P206,26MyonLe Gour de Conche, la cascade ainsi que ses abords.Arrêté du TC0,22100pxPontarlierLe rocher dit Les Dames les Entreportes.Arrêté du TC0,83Roset-FluansLes grottes d'Osselle.Arrêté du TC7,08100pxTouillon-et-LouteletLa source de Fontaine-Ronde, à Touillon-et-Loutelethttp://www.donnees.franche-comte.developpement-durable.gouv.fr/infos_geo/fiches_cartes/sites/sites_fiches/Fiche_SC0085.pdfArrêté du TCVaire-ArcierLes sources d’Arcier et leurs abordsArrêté du 7,63VandoncourtCoquille dans le fichier source. Voir sur cancoillotte.netLe pont Sarrazin.Arrêté du TC1,34100pxVercel-Villedieu-le-CampLes ex deux tilleuls situés devant la chapelle Notre-Dame-des-Malades, à Vercel.Arrêté du TC7,07100pxVillers-le-LacL'ensemble constitué par les bassins et le saut du Doubshttp://www.donnees.franche-comte.developpement-durable.gouv.fr/infos_geo/fiches_cartes/sites/sites_fiches/Fiche_SC0018.pdfDécret du P438,78100pxLe col des Rocheshttp://www.donnees.franche-comte.developpement-durable.gouv.fr/infos_geo/fiches_cartes/sites/sites_fiches/Fiche_SC0171.pdfArrêté du A100pxVuillafansLe vieux pont et les immeubles avoisinants.Arrêté du TC0,29100px
Liste des sites inscrits Nota : Certains sites sont pluri-communaux. D'autres ont fait l'objet de plusieurs arrêtés.