Észtország emlőseinek listája az országban élő emlősöket sorolja fel. Az észt emlős fauna valamivel kevésbé változatos, mint a kontinens délebbi részein lévő faunák, mivel a legutóbbi jégkorszak óta viszonylag kevés idejük volt az állatoknak arra, hogy újra birtokba vegyék a térséget.
Észtországban nem élnek endemikus emlősök.
Rovarevők
Európai sün, Erinaceus europaeus Keleti sün, Erinaceus roumanicus Közönséges vakond, Talpa europaea Erdei cickány, Sorex araneus Középcickány, Sorex caecutiens Törpecickány, Sorex minutus Apró cickány, Sorex minutissimus Közönséges vízicickány, Neomys fodiens
Denevérek Tavi denevér, Myotis dasycneme Vízi denevér, Myotis daubentonii Brandt-denevér, Myotis brandtii Bajuszos denevér, Myotis mystacinus Horgasszőrű denevér, Myotis nattereri Barna hosszúfülű-denevér, Plecotus auritus Durvavitorlájú törpedenevér, Pipistrellus nathusii Közönséges törpedenevér, Pipistrellus pipistrellus Szoprán törpedenevér, Pipistrellus pygmaeus Északi késeidenevér, Eptesicus nilssoni Fehértorkú denevér, Vespertilio murinus Rőt koraidenevér, Nyctalus noctula
Nyúlalakúak Mezei nyúl, Lepus europaeus Havasi nyúl, Lepus timidus
Rágcsálók Európai mókus, Sciurus vulgaris Orosz sutaszárnyúmókus, Pteromys volans Szibériai csíkosmókus, Tamias sibiricus (behurcolt) Eurázsiai hód, Castor fiber Kerti pele, Eliomys quercinus Mogyorós pele, Muscardinus avellanarius Északi szöcskeegér, Sicista betulina Vándorpatkány, Rattus norvegicus Házi patkány, Rattus rattus Erdei egér, Apodemus sylvaticus Sárganyakú erdeiegér, Apodemus flavicollis Pirókegér, Apodemus agrarius Kislábú erdeiegér, Apodemus uralensis Törpeegér, Micromys minutus Házi egér, Mus musculus Pézsmapocok, Ondatra zibethicus (behurcolt) Közönséges kószapocok, Arvicola terrestris Vöröshátú erdeipocok, Myodes glareolus (=Clethrionomys glareolus) Északi pocok, Microtus oeconomus Csalitjáró pocok, Microtus agrestis Kelet-európai pocok, Microtus levis Mezei pocok, Microtus arvalis Közönséges földipocok, Microtus subterraneus Nutria, Myocastor coypus (behurcolt)
Ragadozók Szürke farkas, Canis lupus Vörös róka, Vulpes vulpes Nyestkutya, Nyctereutes procyonoides (behurcolt) Hermelin, Mustela erminea Menyét, Mustela nivalis Európai nyérc, Mustela lutreola Közönséges görény, Mustela putorius Amerikai nyérc, Mustela vison (behurcolt) Európai vidra, Lutra lutra Borz, Meles meles Rozsomák, Gulo gulo Nyuszt, Martes martes Nyest, Martes foina Eurázsiai hiúz, Lynx lynx
Mindenevő Barna medve, Ursus arctos
Úszólábúak Gyűrűsfóka, Phoca hispida Kúpos fóka, Halichoerus grypus
Cetek Barna delfin, Phocoena phocoena
Párosujjú patások Vaddisznó, Sus scrofa Gímszarvas, Cervus elaphus Szikaszarvas, Cervus nippon (betelepített) Európai őz, Capreolus capreolus Jávorszarvas, Alces alces
Kategória:Észtország emlősei