O Galaxy é um sistema de fluxo de trabalho científico de código aberto, cujo projeto para tornar visa tornar a pesquisa científica mais acessível, reproduzível e transparente. Foi originalmente desenvolvido para biologia computacional e evoluiu para uso em várias disciplinas científicas. Alguns exemplos incluem ciência de dados, microbiologia, pesquisa médica, neurociência e virologia.
O Galaxy inclui suporte para desenvolvimento "no-code", visualização em interface gráfica e acesso por linha de comando, além de um agendador de tarefas e gerenciamento de infraestrutura em nuvem. Ele suporta persistência e publicação de dados, reportando uma comunidade global de mais de 500.000 usuários.
Uso O Galaxy foi originalmente desenvolvido para análise de dados biológicos, particularmente genômica. As ferramentas da plataforma são utilizadas pesquisa acadêmica em áreas como análise de expressão gênica, montagem de genomas, epigenômica, transcriptômica e diversas outras disciplinas nas ciências da vida. Por exemplo, existem servidores e ferramentas do Galaxy para análise de imagens, aprendizado de máquina e IA, química computacional e planejamento de fármacos e voos espaciais.
Objetivos do projeto Como a biologia computacional é um domínio especializado que frequentemente requer conhecimento em programação de computadores, o Galaxy foi projetado para fornecer aos pesquisadores biomédicos acesso à biologia computacional sem exigir experiência em programação de computadores. Para atingir esse objetivo, o projeto prioriza uma interface amigável em detrimento da flexibilidade para construir sistemas altamente complexos.
Disponibilidade O Galaxy está disponível:
Como um servidor web público gratuito, apoiado pelo Projeto Galaxy. Este servidor inclui muitas ferramentas de bioinformática que são amplamente úteis em muitas áreas da pesquisa genômica. Os usuários podem criar contas e salvar históricos, fluxos de trabalho e conjuntos de dados no servidor. Os itens salvos também podem ser compartilhados com outras pessoas. Como software de código aberto que pode ser baixado, instalado e personalizado para atender a necessidades específicas. O sistema pode ser instalado localmente ou usando uma nuvem de computação . Servidores web públicos hospedados por outras organizações. Várias organizações com sua própria instalação Galaxy também optaram por disponibilizar esses servidores para outros.
Comunidade A comunidade Galaxy conta com uma rede interdisciplinar de pesquisadores, educadores e desenvolvedores com o objetivo de tornar a bioinformática acessível, reproduzível e colaborativa. Com apoio da academia, do governo e da indústria, a comunidade mantém servidores Galaxy públicos e promove iniciativas de ciência aberta. O projeto Galaxy possui listas de discussão, um centro comunitário, e encontros anuais.
Referências
Categoria:Software de 2005 Categoria:Aplicativos de gerenciamento de fluxo de trabalho Categoria:Projetos de software livre Categoria:Softwares de bioinformática