Aquaria é um jogo de ação-aventura desenvolvido por Alec Holowka e Derek Yu, que publicaram o jogo em 2007 como a empresa independente Bit Blot. O jogo de rolagem lateral acompanha Naija, uma mulher aquática humanoide, enquanto ela explora o mundo subaquático de Aquaria. Em sua jornada, ela aprende sobre a história do mundo que habita, bem como sobre seu próprio passado. A jogabilidade concentra-se em uma combinação de natação, canto e combate, por meio dos quais Naija pode interagir com o mundo. Suas canções podem mover objetos, afetar plantas e animais, e transformar sua aparência física em outras formas com habilidades distintas, como disparar projéteis contra criaturas hostis ou atravessar barreiras inacessíveis em sua forma natural.
Após mais de dois anos de desenvolvimento, o jogo foi lançado no final de 2007 para Windows. Uma versão portada para Mac OS X foi lançada em 2008 pela Ambrosia Software, e uma versão atualizada do jogo foi lançada no serviço Steam no mesmo ano. Uma versão para Linux foi lançada como parte da primeira coleção Humble Indie Bundle em 2010, uma versão para iPad foi lançada em 2011, e uma versão para Android estreou em 2013 junto a outra coleção do Humble Bundle. Em 2009, um álbum com a trilha sonora de Aquaria foi lançado. Ele inclui toda a música do jogo, além de uma nova faixa vocal de nove minutos e alguns remixes.
As avaliações do jogo foram geralmente positivas. Os críticos focaram principalmente nos visuais, na música e na atmosfera como pontos especialmente elogiáveis. Os controles e a jogabilidade também foram bem recebidos, enquanto as críticas negativas concentraram-se com mais frequência no sistema de mapa e na variedade limitada de objetivos. O jogo venceu o Prêmio Seumas McNally no Independent Games Festival em março de 2007.
Jogabilidade thumb|left|Naija em sua forma padrão montando um cavalo-marinho ao lado de um dragão do mar. Ao seu redor está o anel de oito notas por meio do qual o jogador pode executar canções.|alt=Uma mulher humanoide aquática nada para a esquerda da tela. Um grande cavalo-marinho flutua atrás dela, enquanto um cavalo-marinho verde maior flutua à direita. Plantas e formações rochosas são vistas ao redor dela e ao fundo em um verde desbotado Aquaria é um jogo de ação-aventura, com forte ênfase em exploração e resolução de quebra-cabeças, com design de rolagem lateral em 2D e jogabilidade não linear. O jogador controla Naija, uma solitária habitante subaquática; embora semelhante a uma mulher humana, Naija também possui várias qualidades pisciformes, como a capacidade de respirar debaixo d'água e se impulsionar rapidamente com pés palminhos. O jogo, originalmente disponível apenas para computadores pessoais, foi desenvolvido para ser controlado principalmente apenas pelo mouse, embora também possa ser controlado com teclado ou controle de Xbox 360. O jogador guia Naija por um mundo subaquático composto de várias regiões distintas, que variam de cavernas a ruínas submarinas a oásis iluminados pelo sol. Essas áreas são repletas de vida vegetal e animal, que pode ser hostil, amigável ou neutra em relação a ela. Plantas e animais hostis podem machucar Naija, reduzindo sua barra de vida, ao tocá-la ou disparar projéteis contra ela.
Em geral, Naija não pode interagir diretamente com objetos no mundo. Em vez disso, a maioria das ações é realizada por meio do canto de melodias curtas. O jogador faz isso selecionando uma série de notas exibidas em um círculo de oito opções na ordem correta. Cada nota corresponde a uma cor diferente. Cantar notas afeta plantas e objetos da mesma cor que a nota, enquanto cantar as melodias, uma vez aprendidas ao longo da história, pode erguer objetos, criar um escudo ao redor de Naija ou transformá-la em diferentes "formas", que possuem aparências distintas e habilidades únicas, fundamentais para superar os diversos desafios e obstáculos encontrados no jogo. Os tons específicos tocados quando o jogador seleciona uma nota podem mudar sutilmente em diferentes regiões, acompanhando a música de fundo. A forma padrão, ou "forma normal", é a única na qual Naija pode cantar, e é a única em que sua aparência pode ser modificada pelo jogador, fazendo com que Naija vista fantasias encontradas ao longo do jogo.
Outras formas, que só podem ser usadas após serem encontradas no jogo, são a "forma de energia", na qual Naija pode disparar projéteis para atacar criaturas inimigas, a "forma bestial", que permite a Naija nadar mais rápido pela água e comer peixes pequenos para recuperar vida, e a "forma natural", na qual Naija pode disparar sementes que produzem flores e plantas espinhosas capazes de ferir outras criaturas. Nessa forma, Naija não é prejudicada por espinhos em nenhuma planta. O jogador também pode aprender a "forma solar", que permite a Naija emitir luz em regiões escuras, a "forma espiritual", que permite ao jogador se mover para locais específicos marcados por cristais azuis sem que o tempo passe, a "forma peixe", em que Naija se transforma em um peixe pequeno e veloz, e a "forma dual", encontrada no final do jogo, que permite que Naija e outro personagem chamado Li, encontrado no final da trama, se fundam, de modo que as ações de um afetam o outro.
Ao explorar o mundo, Naija pode coletar vários ingredientes por meio da interação com plantas e animais, principalmente ao combater seus inimigos. Esses ingredientes podem ser usados para preparar pratos, que têm efeitos variados sobre Naija. Os efeitos mais comuns são cura e melhoria de diversas características, como velocidade e defesa, mas há alguns pratos mais exóticos que concedem novas habilidades a ela. O jogador pode aprender novas receitas coletando novos pratos diretamente, mas também pode aprendê-las combinando ingredientes sem conhecer previamente a receita.
Enredo thumb|right|Naija na "forma de energia" atacando criaturas marinhas|alt=Uma mulher humanoide aquática cercada por um clarão de luz. Projéteis de energia partem dela em direção a várias pequenas criaturas vermelhas. Plantas e formações rochosas são vistas ao redor dela e ao fundo Quando o jogo começa, Naija perdeu quase todas as suas memórias e desconhece o mundo fora de sua casa enquanto "vive como uma simples criatura". O jogador é informado disso por narrações em voz over na forma de uma história contada por uma Naija futura. Essas narrações servem como a principal fonte de informações sobre Naija ao longo do jogo, embora haja cutscenes ocasionais. Após ser confrontada por uma figura sombria e ser mostrada uma série de flashbacks que ela não compreende, Naija desperta. Sentindo solidão por ser a única membro de sua espécie, Naija decide explorar o mundo ao seu redor. À medida que o jogador explora, Naija descobre cada vez mais sobre a história do mundo, "Aquaria", e sobre seu próprio passado. O jogador não é forçado a seguir a trama em uma sequência determinada. O único fator limitante são barreiras físicas, como áreas que só podem ser acessadas usando uma forma específica. Combinações dessas limitações físicas posicionam alguns elementos da trama mais adiante no jogo. A narrativa da maior parte do jogo centra-se na exploração de Naija por uma série de civilizações em ruínas que ela encontra, cada uma com um grande monstro nelas. Essas civilizações compõem as diferentes regiões do jogo.
Perto do final do jogo, Naija descobre que todas as civilizações em ruínas que encontrou ao longo do jogo foram destruídas por um deus, "o Criador", que tinha ciúmes do crescente poder daquela civilização ou de seus deuses. Os poderosos monstros que ela encontrou e derrotou em cada região eram outrora os deuses daquela civilização. Cada uma dessas civilizações tinha um poder único, simbolizado pela forma que Naija aprende após derrotar seus antigos deuses. Junto com Li, um mergulhador humano da terra que ela conhece no topo do oceano, Naija desce ao fundo do mar para confrontar o deus. Lá ela descobre que o Criador caiu no oceano quando criança e se uniu a um espírito ancestral para obter poderes divinos. Ele então criou Aquaria, entrelaçando um verso de uma canção de ninar que sua mãe lhe cantava, a única parte da canção que ele se lembra. A melodia dessa canção, o "verso", é o que permite a Naija cantar músicas que afetam o mundo ao seu redor; partes da melodia podem ser ouvidas em formas diferentes nas canções dentro da trilha sonora do jogo.
O Criador, após criar Aquaria, criou uma série de civilizações, fazendo uma nova cada vez que uma era destruída. O Criador sequestra Li, por quem Naija se apaixonou, e ela ataca o Criador para recuperá-lo. O jogador derrota o deus como o chefe final do jogo e retorna para casa com Li. No epílogo, Naija é mostrada com Li e seu filho. Se o jogador tiver encontrado todas as memórias de Naija ao descobrir lugares que ela se recorda, elas revelam que a figura sombria do início do jogo era sua mãe, Mia. Mia foi criada pelo Criador e tinha a habilidade, assim como Naija, de usar os diferentes poderes de todas as civilizações. Ela fugiu do Criador e escondeu a si mesma e a Naija em várias comunidades em sucessão; após a destruição da última, apagou as memórias de Naija para que ela descobrisse a história de Aquaria por conta própria e derrotasse o Criador. No epílogo estendido exibido se o jogador tiver encontrado todas as memórias, Mia aparece, dizendo a Naija que as duas podem conquistar as civilizações acima da água. Após Naija recusar, Mia a sequestra e desaparece; o epílogo estendido termina com Lucien - filho de Naija e Li - partindo para encontrá-la. Se o jogador não tiver encontrado todas as memórias, o epílogo termina com Naija pedindo ao jogador que descubra seu passado e revelando que a narração do jogo era destinada a ser ouvida por seu filho.
Desenvolvimento thumb|150px|right|Arte conceitual de Naija|alt=Uma mulher humanoide aquática com pele verde, orelhas grandes e cabelo branco. Ela veste um maiô metálico, braceletes e caneleiras, e ergue a mão esquerda em direção ao observador Aquaria foi desenvolvido por Derek Yu e Alec Holowka ao longo de dois anos, a partir de um conceito que Holowka havia pensado um ano antes. Yu foi o artista principal, e Holowka cuidou da programação e dos componentes de áudio. Ambos os desenvolvedores já haviam trabalhado anteriormente com jogos eletrônicos; Yu havia feito vários jogos freeware, incluindo I'm O.K com Holowka e outros, enquanto Holowka havia trabalhado para diversas startups de jogos eletrônicos, nenhuma das quais havia chegado a publicar um jogo. Alguns trabalhos adicionais no jogo, incluindo parte do design de fases e scripts para alguns inimigos, foram realizados por Brandon McCartin. Holowka e Yu formaram oficialmente o estúdio Bit Blot para apoiar o jogo uma semana antes de submetê-lo ao Independent Games Festival de 2007. Aquaria foi o único jogo do estúdio. Ambos os membros da equipe continuaram a desenvolver jogos eletrônicos, mas não como parceiros; Holowka foi adiante para formar uma equipe separada chamada Infinite Ammo, e Yu foi trabalhar em Spelunky.